[发明专利]用于骨肉瘤分型和评估骨肉瘤预后的基因及其应用有效
申请号: | 202110682475.3 | 申请日: | 2021-06-15 |
公开(公告)号: | CN113355418B | 公开(公告)日: | 2022-11-08 |
发明(设计)人: | 肖建如;魏海峰;周旺;张浩;龚海熠;王霆 | 申请(专利权)人: | 上海长征医院;上海理工大学 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;G01N33/574 |
代理公司: | 上海九泽律师事务所 31337 | 代理人: | 辜佳麒 |
地址: | 200003 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 骨肉 瘤分型 评估 预后 基因 及其 应用 | ||
1.一种用于评估骨肉瘤预后的基因集,其特征在于,所述基因集包括9个基因,如下表所示:
2.根据权利要求1所述的用于评估骨肉瘤预后的基因集,其特征在于,所述基因集包括权利要求1所述的9个基因,以及ABCF1、ADAMTS1、ALDH3A2、ALKBH5、ATPAF2、C19orf12、CENPV、CPNE3、DRG2、EPN2、FLII、FSCN1、GID4、HIST1H2BD、LSM2、MPRIP、MYO15A、PEMT、PI15、PRAME、PRR3、TOM1L2、TTC19、VARS、AEBP1、ASPN、C1R、C1S、COL12A1、COL5A1、COL6A3、OLFML2B、POSTN、SFRP4和THBS2中的至少一个基因。
3.一种用于评估骨肉瘤预后的基因集,其特征在于,所述基因集是由44个基因组成的基因群,所述基因群如表3所示。
4.如权利要求1-3任一项所述的基因集在制备用于评估骨肉瘤预后的检测试剂盒中的应用,所述检测试剂盒包括: 扩增权利要求1-3任一项所述用于评估骨肉瘤预后的基因集的基因的引物;和/或
特异性结合权利要求1-3任一项所述用于评估骨肉瘤预后的基因集的基因和/或其互补序列的探针;和/或
特异性结合权利要求1-3任一项所述用于评估骨肉瘤预后的基因集的基因表达的蛋白的抗体。
5.根据权利要求4所述的应用,其特征在于,所述引物包括:核苷酸序列如SEQ ID NO.1 - SEQ ID NO.18所示的引物。
6.如权利要求1-3任一项所述的基因集在制备用于评估骨肉瘤预后的蛋白检测芯片中的应用,其特征在于,所述蛋白检测芯片包括固相载体和检测抗体,在所述固相载体上固定有与权利要求1-3任一项所述的基因集的基因特异性结合的捕获抗体,所述检测抗体与抗体标记物连接。
7.一种用于评估骨肉瘤预后的试剂盒,其特征在于,包括
1)扩增权利要求1-3任一项所述用于评估骨肉瘤预后的基因集的基因的引物;和/或
2)特异性结合权利要求1-3任一项所述用于评估骨肉瘤预后的基因集的基因和/或其互补序列的探针;和/或
3)特异性结合权利要求1-3任一项所述用于评估骨肉瘤预后的基因集的基因表达的蛋白的抗体。
8.根据权利要求7所述的试剂盒,其特征在于,所述检测试剂盒包括:总RNA抽提试剂、逆转录试剂和/或测序试剂。
9.根据权利要求8所述的试剂盒,其特征在于,所述检测试剂盒包括:dNTP溶液和 /或RNA逆转录酶。
10.根据权利要求8所述的试剂盒,其特征在于,所述的测序试剂包括二代测序试剂或单细胞测序试剂。
11.根据权利要求7-10任一项所述的试剂盒,其特征在于,所述引物包括:核苷酸序列如SEQ ID NO. 1 - SEQ ID NO. 18所示的引物。
12.一种用于骨肉瘤分型和评估骨肉瘤预后的蛋白检测芯片,其特征在于,所述蛋白检测芯片包括固相载体和检测抗体,在所述固相载体上固定有与权利要求1-4任一项所述的基因集的基因特异性结合的捕获抗体,所述检测抗体与抗体标记物连接。
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