[发明专利]一种利用SSR分子标记法鉴定青稞品种的方法及其用途有效
申请号: | 202110685583.6 | 申请日: | 2021-06-21 |
公开(公告)号: | CN113355444B | 公开(公告)日: | 2022-06-24 |
发明(设计)人: | 姚晓华;吴昆仑;姚有华;安立昆;白羿雄 | 申请(专利权)人: | 青海大学 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/686;C12N15/11 |
代理公司: | 成都华风专利事务所(普通合伙) 51223 | 代理人: | 杜朗宇 |
地址: | 810000 青*** | 国省代码: | 青海;63 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 利用 ssr 分子 标记 鉴定 青稞 品种 方法 及其 用途 | ||
1. 一种SSR引物,其特征在于,所述SSR引物由Seq ID No.3和Seq ID No.4,Seq IDNo.7和Seq ID No.8,Seq ID No.11和Seq ID No.12,Seq ID No.25和Seq ID No.26,SeqID No.29和Seq ID No.30,和Seq ID No.33和Seq ID No.34所示的序列组成。
2.一种利用SSR分子标记法鉴定青稞品种的方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)提取青稞品种样品的DNA;
(2)用权利要求1所述SSR引物进行PCR扩增、变性聚丙烯酰胺凝胶电泳及银染、毛细管电泳;
所述样品选自青稞籽粒、胚、胚芽、幼苗、叶片中的一种或几种;
所述青稞品种为甘青7号、甘青6号、甘青5号、黄青2号、甘青4号、阿青6号、阿青5号、藏青13号、昆仑14号、岩石稞、藏青690、昆仑15号、藏青320、喜马拉雅19号、云稞1号、龙稞4号、康青8号、喜马拉雅22号、康青9号、肚里黄、龙稞5号、藏青2000、甘青2号或云稞4号。
3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述PCR扩增的反应程序为:
94℃预变性4.5~5.5min;94℃变性25~35s,50~65℃退火55~65s,72℃延伸25~35s,10~15个循环,每循环降0.5~1.2℃;94℃变性25~35s,50℃退火40~50s,72℃延伸25~35s,20~25个循环;72℃延伸9~12 min。
4.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述变性聚丙烯酰胺凝胶电泳的具体步骤包括:
(a)取6%变性聚丙烯酰胺溶液、四甲基乙二胺、10%过硫酸胺,混匀,制胶;
(b) 将PCR扩增产物与加样缓冲液混匀,变性后冷却,进行电泳。
5.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述变性的条件为92~98℃变性4.5~5.5min;
所述电泳的条件为恒定功率60~80W,电泳时间1.5~2.5h;
所述电泳时,凝胶的温度为45~55℃。
6.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述银染的步骤包括:将凝胶固定后水洗,银染15~20min后再水洗,显色至条带清晰后定影;
所述固定的条件为20~35 rpm固定15~25 min;
所述水洗的时间≤10s/次;所述定影时间为4.5~5.5min。
7.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述毛细管电泳的具体步骤包括:取等体积同一组合引物的不同荧光标记的扩增产物,混匀,得到混合液,吸取混合液、分子量内标和去离子甲酰胺加入到96孔板上,变性、冷却、离心,电泳;
所述内标的用量为0.05~0.15μL;
所述去离子甲酰胺的用量为8~9.5μL;
所述变性的条件为90~100 ℃,3~7min。
8.权利要求1所述引物在青稞品种鉴定中的用途;
所述青稞品种为甘青7号、甘青6号、甘青5号、黄青2号、甘青4号、阿青6号、阿青5号、藏青13号、昆仑14号、岩石稞、藏青690、昆仑15号、藏青320、喜马拉雅19号、云稞1号、龙稞4号、康青8号、喜马拉雅22号、康青9号、肚里黄、龙稞5号、藏青2000、甘青2号或云稞4号。
9.权利要求1所述引物在青稞品种的遗传亲缘关系的分析中的用途;
所述青稞品种为甘青7号、甘青6号、甘青5号、黄青2号、甘青4号、阿青6号、阿青5号、藏青13号、昆仑14号、岩石稞、藏青690、昆仑15号、藏青320、喜马拉雅19号、云稞1号、龙稞4号、康青8号、喜马拉雅22号、康青9号、肚里黄、龙稞5号、藏青2000、甘青2号或云稞4号。
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