[发明专利]检测水稻耐盐性基因SKC1NB

说明书

本发明公开了一种检测水稻耐盐性基因SKC1^NB的KASP分子标记及其方法，所述分子标记是根据SKC1^NB基因SNP2处发生由G→A的突变而设计的，命名为SKC1^NB‑KASP。所述KASP标记引物包括两条正向特异性引物和一条反向通用引物。根据本发明提供的KASP标记进行基因分型，在PCR扩增后不用酶切和电泳，可以高通量检测多个样品，快速检测SKC1^NB等位基因在水稻分离群体中的分布情况，结果准确性好，与常规分子标记相比具有快捷、简便和成本较低等优点。本发明对水稻耐盐性基因SKC1^NB的分子标记辅助选择育种具有重要意义。

技术领域

本发明涉及一种检测水稻耐盐性基因SKC1^NB的KASP分子标记及方法，属水稻育种技术领域。

背景技术

我国是一个人口众多，耕地资源相对紧张的国家。近年来，还一直面临土壤盐碱化日益加剧的问题，土壤盐碱化会对水稻产量造成很大的影响(Lei and Tan et al,2011；孟丽君,2012)。目前，我们有内陆盐碱面积近1亿hm2，滩涂面积234万hm2(王才林与张亚东等,2019)。如何将这些盐碱地利用起来，种植粮食，预防土壤盐碱化后无地可种局面的发生，是当前面临的一个巨大挑战。盐碱胁迫对作物生长发育有极大的抑制作用，高离子浓度的盐碱地对植株形成渗透压，严重影响作物各项生理活动的进行，抑制植株生长发育并最终造成死亡 (梁正伟与杨福等,2004)。耐盐碱水稻的研究可追溯到1939年的印度，斯里兰卡等人培育出第一个强耐盐性水稻品种Pokkali(孙明法与严国红等,2017)，此后，耐盐碱性水稻品种的育种工作便在世界各地陆续开展。我国曾对全国各地水稻种质资源进行了耐盐性鉴定，来筛选可用资源。在此期间中国农业科学院组织相关单位协作，筛选出上百份的耐盐品系，但是这些品种耐盐性状较弱，无法在重度盐碱地成活，且因为农艺性状较差等原因，并不适合生产推广(周汝倫与侯家龙等,1983；郭望模与应存山等,1993)。因此，从基因层面出发，挖掘水稻耐盐碱性位点，通过分子育种将耐盐碱位点转入性状优良的水稻品种中，是培育优质耐盐碱水稻品种的关键。