[发明专利]m6 有效
申请号: | 202110711644.1 | 申请日: | 2021-06-25 |
公开(公告)号: | CN113462776B | 公开(公告)日: | 2023-03-28 |
发明(设计)人: | 田熙;瞿元元;徐文浩;艾合太木江·安外尔;朱殊璇;王骏;施国海;叶定伟 | 申请(专利权)人: | 复旦大学附属肿瘤医院 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12N15/11;G16B50/00;G16B35/00 |
代理公司: | 上海顺华专利代理有限责任公司 31203 | 代理人: | 蒋骏杰 |
地址: | 200032 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | base sup | ||
1.检测生物样品中m6A修饰相关联合基因组各基因相对表达水平的试剂在制备肾透明细胞癌免疫治疗疗效预测试剂或试剂盒中的应用,其特征在于,该联合基因组为HNRNPA2B1和ALKBH5的联合。
2.根据权利要求1所述应用,其特征在于,所述预测试剂盒包含了检测生物样品中HNRNPA2B1和ALKBH5相对表达水平的试剂组合。
3.根据权利要求1或2所述的应用,其特征在于,所述试剂组合中包含对上述基因具有检测特异性的PCR引物,该PCR引物序列如SEQ ID NO.1~4所示。
4.根据权利要求1或2所述的应用,其特征在于,所述生物样品为肾透明细胞癌患者手术切除的肿瘤标本切片。
5.一种肾透明细胞癌免疫治疗疗效预测试剂盒,其特征在于:由逆转录系统、引物系统和扩增系统组成,所述的引物系统包括如SEQ ID NO.1~4所示的PCR引物。
6.一种肾透明细胞癌免疫治疗疗效预测系统,其特征在于,包括预测试剂盒以及安装在终端载体上的免疫亚群分类模型,
所述预测试剂盒为权利要求5所述的试剂盒,所述免疫亚群分类模型根据下述公式进行预测评分,并根据分值确定当前样本的免疫分型属于免疫排斥型还是免疫荒漠型,
预测评分=1.889*HNRNPA2B1表达水平-0.451*ALKBH5表达水平。
7.根据权利要求6所述的肾透明细胞癌免疫治疗疗效预测系统,其特征在于,
其中,所述免疫亚群分类模型根据二元logistic回归构建,并采用二元logistic分析对预测评分与患者对免疫治疗的显著相关性进行预测。
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