[发明专利]冠状病毒信息数据的处理方法、装置、电子设备及介质在审
申请号: | 202110725025.8 | 申请日: | 2021-06-29 |
公开(公告)号: | CN113611365A | 公开(公告)日: | 2021-11-05 |
发明(设计)人: | 孙清岚;范国梅;史文聿;吴林寰;马俊才;张幸姣;孙秀强;林思汝 | 申请(专利权)人: | 中国科学院微生物研究所 |
主分类号: | G16B40/00 | 分类号: | G16B40/00;G16B50/00;G16H50/70;G16H50/80 |
代理公司: | 北京植德律师事务所 11780 | 代理人: | 唐华东 |
地址: | 100101 北*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 冠状病毒 信息 数据 处理 方法 装置 电子设备 介质 | ||
1.一种冠状病毒信息数据的处理方法,包括:
获取冠状病毒信息数据,其中,所述冠状病毒信息数据包括冠状病毒生物数据集和所述冠状病毒生物数据集中的每个冠状病毒生物数据对应的冠状病毒元数据;所述冠状病毒生物数据集包括冠状病毒核酸数据、冠状病毒蛋白数据、冠状病毒晶体结构数据和冠状病毒抗体数据中的至少一种数据;所述冠状病毒元数据包括宿主名称、国家名称、病毒名称、物种分类名称和分离物名称中的至少一个字段;
根据预设的标准化词库,将所述冠状病毒元数据中字段的字段值处理为相应的标准化字段值,得到相应的冠状病毒标准化元数据;
根据所述冠状病毒标准化元数据,在对应相同所述标准化字段值的至少两个所述冠状病毒生物数据之间建立关联关系,以形成冠状病毒信息整合数据集。
2.根据权利要求1所述的方法,其中,所述冠状病毒生物数据集包括冠状病毒核酸数据、冠状病毒蛋白数据、冠状病毒晶体结构数据和冠状病毒抗体数据中的至少两种数据,所述冠状病毒元数据包括病毒名称,所述冠状病毒标准化元数据包括标准化病毒名称;以及
所述根据所述冠状病毒标准化元数据,在对应相同所述标准化字段值的至少两个所述冠状病毒生物数据之间建立关联关系,包括:
在对应相同所述标准化病毒名称的至少两种所述冠状病毒生物数据之间建立关联关系。
3.根据权利要求1所述的方法,其中,所述冠状病毒生物数据集包括冠状病毒核酸数据,所述冠状病毒核算数据从美国国家生物技术信息中心GenBank数据库、中国国家微生物科学数据中心数据库、中国国家基因组科学数据中心数据库和中国国家基因库数据库中的至少一个数据库获取。
4.根据权利要求1所述的方法,其中,所述冠状病毒生物数据包括冠状病毒蛋白数据,所述冠状病毒蛋白数据从美国国家生物信息中心蛋白质数据库、Uniprot通用蛋白质数据库中的至少一个数据库获取。
5.根据权利要求1所述的方法,其中,所述冠状病毒生物数据包括所述冠状病毒晶体结构数据,所述冠状病毒晶体结构数据从PDB蛋白质结构数据库获取。
6.根据权利要求1所述的方法,其中,所述冠状病毒生物数据包括所述冠状病毒抗体数据,所述冠状病毒抗体数据从CoV-AbDab冠状病毒抗体数据库获取。
7.根据权利要求1-6中任一项所述的方法,其中,所述根据预设的标准化词库,将所述冠状病毒元数据中字段的字段值处理为相应的标准化字段值,包括:
对于所述冠状病毒元数据中的每个字段,在该字段对应的标准化词库中查找与该字段的字段值匹配的标准词;
响应于查找到,将所查找到的标准词确定为该字段的标准化字段值。
优选地,所述根据所述冠状病毒标准化元数据,在对应相同所述标准化字段值的至少两个所述冠状病毒生物数据之间建立关联关系,包括:
确定至少两个所述冠状病毒生物数据是否对应相同的所述标准化字段值;
响应于确定是,在所述至少两个所述冠状病毒生物数据之间添加所述关联关系。
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