[发明专利]冠状病毒信息数据的处理方法、装置、电子设备及介质在审

专利信息
申请号: 202110725025.8 申请日: 2021-06-29
公开(公告)号: CN113611365A 公开(公告)日: 2021-11-05
发明(设计)人: 孙清岚;范国梅;史文聿;吴林寰;马俊才;张幸姣;孙秀强;林思汝 申请(专利权)人: 中国科学院微生物研究所
主分类号: G16B40/00 分类号: G16B40/00;G16B50/00;G16H50/70;G16H50/80
代理公司: 北京植德律师事务所 11780 代理人: 唐华东
地址: 100101 北*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 冠状病毒 信息 数据 处理 方法 装置 电子设备 介质
【说明书】:

本公开涉及冠状病毒信息数据的处理方法、装置、电子设备及介质。该方法包括:获取冠状病毒信息数据;根据预设的标准化词库,将冠状病毒元数据中字段的字段值处理为相应的标准化字段值,得到相应的冠状病毒标准化元数据;根据冠状病毒标准化元数据,在对应相同标准化字段值的至少两个冠状病毒生物数据之间建立关联关系,以形成冠状病毒信息整合数据集。该方法实现了冠状病毒信息数据的标准化和关联化,能够形成冠状病毒信息整合数据集,有利于对冠状病毒的研究分析工作起到推动作用。

技术领域

本公开涉及微生物技术领域,具体涉及冠状病毒信息数据的处理方法、装置、电子设备及介质。

背景技术

冠状病毒自从被发现以来,人们对其病毒结构、致病、传染、分子生物学研究、基因组测序等等方面进行科学研究,产生了多种科学数据。

为了推动冠状病毒信息数据的研究工作,通常由特定机构对冠状病毒信息数据进行记录和公开。但是,现有的冠状病毒信息数据分散在不同的数据库和数据平台中,一方面不同数据源的冠状病毒信息数据存在不一致问题,另一方面不同数据源的冠状病毒信息数据之间缺少关联性。上述冠状病毒信息数据的不一致和缺少关联现象会对冠状病毒的研究和分析工作带来不利影响。

发明内容

本公开提出了冠状病毒信息数据的处理方法、装置及电子设备。

第一方面,本公开提供了一种冠状病毒信息数据的处理方法,包括:

获取冠状病毒信息数据,其中,所述冠状病毒信息数据包括冠状病毒生物数据集和所述冠状病毒生物数据集中的每个冠状病毒生物数据对应的冠状病毒元数据;所述冠状病毒生物数据集包括冠状病毒核酸数据、冠状病毒蛋白数据、冠状病毒晶体结构数据和冠状病毒抗体数据中的至少一种数据;所述冠状病毒元数据包括宿主名称、国家名称、病毒名称、物种分类名称和分离物名称中的至少一个字段;

根据预设的标准化词库,将所述冠状病毒元数据中字段的字段值处理为相应的标准化字段值,得到相应的冠状病毒标准化元数据;

根据所述冠状病毒标准化元数据,在对应相同所述标准化字段值的至少两个所述冠状病毒生物数据之间建立关联关系,以形成冠状病毒信息整合数据集。

在一些可选的实施方式中,所述冠状病毒生物数据集包括冠状病毒核酸数据、冠状病毒蛋白数据、冠状病毒晶体结构数据和冠状病毒抗体数据中的至少两种数据,所述冠状病毒元数据包括病毒名称,所述冠状病毒标准化元数据包括标准化病毒名称;以及

所述根据所述冠状病毒标准化元数据,在对应相同所述标准化字段值的至少两个所述冠状病毒生物数据之间建立关联关系,包括:

在对应相同所述标准化病毒名称的至少两种所述冠状病毒生物数据之间建立关联关系。

在一些可选的实施方式中,所述冠状病毒生物数据集包括冠状病毒核酸数据,所述冠状病毒核算数据从美国国家生物技术信息中心GenBank数据库、中国国家微生物科学数据中心数据库、中国国家基因组科学数据中心数据库和中国国家基因库数据库中的至少一个数据库获取。

在一些可选的实施方式中,所述冠状病毒生物数据包括冠状病毒蛋白数据,所述冠状病毒蛋白数据从美国国家生物信息中心蛋白质数据库、Uniprot通用蛋白质数据库中的至少一个数据库获取。

在一些可选的实施方式中,所述冠状病毒生物数据包括所述冠状病毒晶体结构数据,所述冠状病毒晶体结构数据从PDB蛋白质结构数据库获取。

在一些可选的实施方式中,所述冠状病毒生物数据包括所述冠状病毒抗体数据,所述冠状病毒抗体数据从CoV-AbDab冠状病毒抗体数据库获取。

在一些可选的实施方式中,所述根据预设的标准化词库,将所述冠状病毒元数据中字段的字段值处理为相应的标准化字段值,包括:

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