[发明专利]用于预测肺癌患者生存期的生物标志物及相关产品在审
申请号: | 202110726863.7 | 申请日: | 2021-06-29 |
公开(公告)号: | CN113373232A | 公开(公告)日: | 2021-09-10 |
发明(设计)人: | 杨承刚;李雨晨 | 申请(专利权)人: | 北京泱深生物信息技术有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;G01N33/574;G16H50/30;G16B40/00 |
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地址: | 100176 北京市大兴区*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 预测 肺癌 患者 生存 生物 标志 相关 产品 | ||
1.检测生物标志物的试剂在制备预测肺癌预后的产品中的应用,其特征在于,所述生物标志物包括ARRB1、GRIA1、HDC和/或KRT8。
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述生物标志物为ARRB1、GRIA1、HDC和KRT8。
3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,所述试剂包括通过数字成像技术、蛋白免疫技术、染料技术、核酸测序技术、核酸杂交技术、色谱技术、质谱技术检测样本中生物标志物表达水平的试剂。
4.根据权利要求3所述的应用,其特征在于,所述试剂样本包括组织、体液。
5.一种预测肺癌预后的产品,其特征在于,所述产品包括检测生物标志物的试剂,所述生物标志物包括ARRB1、GRIA1、HDC和/或KRT8;
优选地,所述产品包括芯片、试剂盒;
优选地,所述试剂盒包括qPCR试剂盒、免疫印迹检测试剂盒、免疫层析检测试剂盒、流式细胞分析试剂盒、免疫组化检测试剂盒、ELISA试剂盒和电化学发光检测试剂盒;
优选地,所述试剂盒还包括用于预测肺癌预后的说明书。
6.根据权利要求5所述的产品,其特征在于,所述试剂包括与所述生物标志物基因特异性结合的引物或探针;与所述标志物蛋白特异性结合的抗体、肽、适配体或化合物。
7.一种预测肺癌预后的系统/装置,其特征在于,包括:
获取单元,用于获取待测样本中生物标志物的数据,所述生物标志物包括ARRB1、GRIA1、HDC和/或KRT8;
处理单元,用于将所述生物标志物的数据输入肺癌预后预测模型中,获得待测样本肺癌进展的预测结果。
优选地,所述预后预测模型为Cox回归模型;
优选地,所述Cox回归模型为LASSOCox回归模型;
优选地,所述预后预测模型的公式为风险评分=C1*ExpARRB1+C2*ExpGRIA1+C3*ExpHDC+C4*ExpKRT8;
优选地,所述C1、C2、C3、C4分别为-0.2098、-0.06767、-0.08691、0.2197。
8.一种计算机可读存储介质,其特征在于,其存储有程序,所述程序用于执行由生物标志物ARRB1、GRIA1、HDC和/或KRT8构建的肺癌预后预测模型;
优选地,所述预后预测模型为Cox回归模型;
优选地,所述Cox回归模型为LASSOCox回归模型;
优选地,所述预后预测模型的公式为风险评分=C1*ExpARRB1+C2*ExpGRIA1+C3*ExpHDC+C4*ExpKRT8;
优选地,所述C1、C2、C3、C4分别为-0.2098、-0.06767、-0.08691、0.2197。
9.一种电子设备,其特征在于,包括:
客户端组件,其中所述客户端组件包含用户界面;
服务器组件,其中所述服务器组件包含至少一个存储器单元,该至少一个存储器单元被配置为接收包含从样本中生成的生物标志物的测序数据的数据输入,所述生物标志物包括ARRB1、GRIA1、HDC和/或KRT8;
与所述服务器组件可操作地耦合的所述用户界面;以及
与所述至少一个存储器单元可操作地耦合的计算机处理器,其中所述计算机处理器被编程为可执行程序,可执行程序用于运行由生物标志物构建的肺癌预后预测模型;
优选地,所述预后预测模型为Cox回归模型;
优选地,所述Cox回归模型为LASSOCox回归模型;
优选地,所述预后预测模型的公式为风险评分=C1*ExpARRB1+C2*ExpGRIA1+C3*ExpHDC+C4*ExpKRT8;
优选地,所述C1、C2、C3、C4分别为-0.2098、-0.06767、-0.08691、0.2197。
10.检测生物标志物的试剂在制备药物治疗肺癌的效果评价的产品中的应用,其特征在于,所述生物标志物包括ARRB1、GRIA1、HDC和/或KRT8;
优选地,所述试剂包括与所述生物标志物基因特异性结合的引物或探针;与所述标志物蛋白特异性结合的抗体、肽、适配体或化合物。
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