[发明专利]一种可以快速检测鸡球虫耐药性的分子标记、检测方法及试剂盒在审

专利信息
申请号: 202110728735.6 申请日: 2021-06-29
公开(公告)号: CN113584198A 公开(公告)日: 2021-11-02
发明(设计)人: 韩红玉;董辉;黄文浩;黄兵;赵其平;朱顺海;于钰;姚亚文;刘展 申请(专利权)人: 中国农业科学院上海兽医研究所(中国动物卫生与流行病学中心上海分中心)
主分类号: C12Q1/6893 分类号: C12Q1/6893;C12Q1/686;C12Q1/6806;C12N15/60;C12N15/53;C12N15/54
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 200241 *** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 一种 可以 快速 检测 鸡球虫 耐药性 分子 标记 方法 试剂盒
【权利要求书】:

1.一种可以快速检测球虫耐药性的分子标记,所述分子标记为柔嫩艾美耳球虫烯醇酶2(EtENO2)、磷酸甘油酸激酶(EtPGK)、醛酮还原酶家族的氧化还原酶(EtAKRO)。

2.如权利要求1所述的分子标记,其中,所述柔嫩艾美耳球虫烯醇酶2(EtENO2)的序列如SEQ ID NO.15所示;所述磷酸甘油酸激酶(EtPGK)的序列如SEQ ID NO.16所示;所述醛酮还原酶家族的氧化还原酶(EtAKRO)的序列如SEQ ID NO.17所示。

3.一种快速检测球虫耐药性分子标记的应用,所述应用为利用相对荧光定量PCR来测定鸡球虫对抗球虫药地克珠利、马杜拉霉素的耐药性,所述方法为:

模板的制备:

1)总RNA的提取;提取柔嫩艾美耳球虫敏感株、实验室诱导的地克珠利耐药株、马杜拉霉素耐药株和田间分离株的虫体RNA,随后进行凝胶电泳实验检测RNA的完整性,并利用Nano Drop™测定RNA的浓度与质量;

2)去除基因组DNA;按照下表中的体系向无RNAase离心管中依次加入各试剂,充分混匀后将其放入37℃的水浴锅中孵育30~35min,之后再置于冰上静置3min;

3)RNA的纯化;使用RNeasy Mini Kit试剂盒对提取后的RNA进行纯化(具体步骤见说明书);之后按照说明书对RNA进行反转录,以此获得柔嫩艾美耳球虫不同虫株的cDNA;

4)cDNA的纯化;利用cDNA纯化试剂盒(QIAGEN)对上一步反转录获得的cDNA进行纯化后,即可获得qPCR的模板;置于-20℃保存备用;

荧光定量PCR:

1)使用软件Primer Premier 5.0设计上下游引物;

2)将柔嫩艾美耳球虫敏感株卵囊的cDNA作为标准品,按照1:10的比例,倍比稀释成5个浓度梯度以制作标准曲线;

3)以上述制备的虫体cDNA作为模板,18s rRNA作为对照,采用SYBR Green I三步法以检测基因在不同虫株的mRNA转录水平的高低;

PCR反应结束后以18s rRNA的结果作为对照,通过计算获得目的基因的相对扩增量;为减小误差,每个样品至少设置三个重复;

对mRNA转录水平进行分析获得鸡球虫对不同药物的耐药程度。

4.一种快速检测球虫耐药性分子标记的应用,所述应用为利用球虫耐药性分子标记区分敏感株与不同耐药株,具体为采用qPCR的方法比较基因EtENO2、EtPGK和EtAKRO的mRNA的转录水平在不同虫株中的差异。

5.一种快速检测球虫耐药性分子标记的检测试剂盒,所述试剂盒包括可以分别扩增柔嫩艾美耳球虫烯醇酶2(EtENO2)、磷酸甘油酸激酶(EtPGK)、醛酮还原酶家族的氧化还原酶(EtAKRO)的引物对;

所述的引物对为:

如权利要求5所述的一种检测试剂盒的应用,所述引用为检测样品中球虫,所述样品包括但不限于生物样品、食品、水源、土壤等。

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