[发明专利]一种与抗4-1BB抗体结合的抗原表位肽及其抗原抗体复合物晶体在审

专利信息
申请号: 202110739072.8 申请日: 2021-06-30
公开(公告)号: CN115505036A 公开(公告)日: 2022-12-23
发明(设计)人: 程联胜;牛立文;朱敏;周鹏飞;刘雯婷;张大艳;周维明;曾小丽 申请(专利权)人: 合肥瀚科迈博生物技术有限公司
主分类号: C07K14/705 分类号: C07K14/705;C07K16/28;C07K19/00;C12N15/12;C12N15/13;G01N33/68;G01N33/574;A61K39/395;A61K39/00;A61P35/00
代理公司: 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 代理人: 张立娜
地址: 230088 安徽省合肥*** 国省代码: 安徽;34
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摘要:
搜索关键词: 一种 bb 抗体 结合 抗原 表位肽 及其 复合物 晶体
【权利要求书】:

1.4-1BB抗原表位肽,为如下I或II:

I:氨基酸序列如SEQ ID No.1的第39-65位所示的多肽;

II:在I所示多肽的基础上,除了SEQ ID No.1的第40位、第49位、第58位、第60位、第61位、第62位、第63位和第64位外,其他位点进行一个或多个氨基酸残基的保守替换后得到的具有相同功能的多肽。

2.4-1BB抗原表位肽,其特征在于:所述4-1BB抗原表位肽为能够与ZG033抗体或其抗原结合片段相结合的多肽;所述ZG033抗体的重链可变区中HCDR1、HCDR2和HCDR3的氨基酸序列依次如SEQ ID No.2自N端起第31-35位、第50-65位、第98-106位所示;所述ZG033抗体的轻链可变区中LCDR1、LCDR2和LCDR3的氨基酸序列依次如SEQ ID No.3自N端起第24-34位、第50-56位、第89-97位所示;

所述4-1BB抗原表位肽与所述ZG033抗体或其抗原结合片段的结合位点为:SEQ IDNo.2的第31位丝氨酸、第32位酪氨酸、第50位的缬氨酸、第52位的色氨酸、第54位的甘氨酸、第100位的甘氨酸、第101位的苏氨酸、第102位的色氨酸,以及SEQ ID No.3的第49位酪氨酸、第94位亮氨酸、第96位色氨酸。

3.根据权利要求2所述的4-1BB抗原表位肽,其特征在于:

所述4-1BB抗原表位肽依靠精氨酸、苏氨酸和半胱氨酸分别与SEQ ID No.2的第100位的甘氨酸、第101位的苏氨酸和第102位的色氨酸形成氢键;

所述4-1BB抗原表位肽依靠精氨酸与SEQ ID No.2的第32位酪氨酸形成氢键;

所述4-1BB抗原表位肽依靠天冬酰胺与SEQ ID No.3的第49位酪氨酸形成氢键;

所述4-1BB抗原表位肽依靠精氨酸、甘氨酸与SEQ ID No.2的第31位丝氨酸形成氢键;

所述4-1BB抗原表位肽依靠天冬氨酸与SEQ ID No.2的第54位的甘氨酸形成氢键;

所述4-1BB抗原表位肽依靠脯氨酸、半胱氨酸、异亮氨酸与SEQ ID No.2的第50位的缬氨酸、第52位的色氨酸、第101位的苏氨酸、第102位的色氨酸,以及SEQ ID No.3的第94位亮氨酸、第96位色氨酸形成疏水相互作用。

4.一种抗原抗体复合物晶体,由4-1BB抗原胞外区与ZG033抗体的抗原结合片段Fab组成;所述4-1BB抗原胞外区的氨基酸序列如SEQ ID No.1的第24-186位或第24-194位所示;所述ZG033抗体的抗原结合片段Fab的重链氨基酸序列如SEQ ID No.2的第1-215位或SEQID No.2所示,轻链氨基酸序列如SEQ ID No.3所示;

所述抗原抗体复合物晶体结构参数如下:

所述抗原抗体复合物晶体属于P1空间群;分辨率范围:19.91-2.30埃;晶胞参数为:a=60.021埃,b=65.913埃,c=83.643埃;α=90度,β=82.495度,γ=74.822度;一个不对称单位分子包含2个分子,每个分子均为所述4-1BB抗原胞外区及所述ZG033抗体的抗原结合片段Fab的复合物;工作R因子和自由R因子分别为21.6%和27.49%;键长均方根偏差为0.004埃,键角均方根偏差为0.62度;溶剂含量为56.3%。

5.权利要求1-3中任一所述的4-1BB抗原表位肽在如下任一中的应用:

P1、作为免疫原制备抗4-1BB抗体;

P2、制备用于检测ZG033抗体或其抗原结合片段的产品;所述ZG033抗体的重链可变区中HCDR1、HCDR2和HCDR3的氨基酸序列依次如SEQ ID No.2自N端起第31-35位、第50-65位、第98-106位所示;所述ZG033抗体的轻链可变区中LCDR1、LCDR2和LCDR3的氨基酸序列依次如SEQ ID No.3自N端起第24-34位、第50-56位、第89-97位所示;

P3、制备用于诊断4-1BB表达异常所致疾病产品;

P4、制备用于治疗和或预防4-1BB表达异常所致疾病产品。

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