[发明专利]一种基于CRISPR技术检测口蹄疫病毒的方法在审
申请号: | 202110740249.6 | 申请日: | 2021-06-30 |
公开(公告)号: | CN114480384A | 公开(公告)日: | 2022-05-13 |
发明(设计)人: | 王丽梅;梁亚峰 | 申请(专利权)人: | 山东舜丰生物科技有限公司 |
主分类号: | C12N15/113 | 分类号: | C12N15/113;C12Q1/70;C12Q1/6816;C12R1/93 |
代理公司: | 北京君慧知识产权代理事务所(普通合伙) 11716 | 代理人: | 冯妙娜 |
地址: | 250201 山东省济南市高新*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 crispr 技术 检测 口蹄疫病毒 方法 | ||
1.一种用于检测口蹄疫病毒的gRNA,所述gRNA包括与V型Cas蛋白结合的区域和与靶核酸杂交的导向序列,所述靶核酸为来源于口蹄疫病毒的核酸;其特征在于,所述与靶核酸杂交的导向序列选自下组任意一种或其组合:
(1)所述与靶核酸杂交的导向序列含有20-30个碱基,并且与SEQ ID No.1所示的序列或其反向互补序列杂交,并且所述导向序列包含SEQ ID No.3-6任一所示的序列;
(2)所述与靶核酸杂交的导向序列包含SEQ ID No.3-6任一所示的序列,并且在SEQ IDNo.3-6任一所示的序列的3’端还包括1-10个碱基,并且,所述与靶核酸杂交的导向序列与SEQ ID No.1或其反向互补序列杂交;
(3)所述与靶核酸杂交的导向序列与SEQ ID No.3-6任一所示的序列相比,在SEQ IDNo.3-6任一所示的序列的3’端连续缺失1-5个碱基;
(4)所述与靶核酸杂交的导向序列如SEQ ID No.3-6任一所示。
2.一种检测口蹄疫病毒的方法,所述方法包括将待测核酸与V型Cas蛋白、权利要求1所述的gRNA和单链核酸检测器接触;检测由Cas蛋白切割单链核酸检测器产生的可检测信号,从而检测口蹄疫病毒。
3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述方法还包括从待测样品中获得待测核酸的步骤。
4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,所述样品为来自动物的样品。
5.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述可检测信号可通过以下任一方式实现:基于视觉的检测,基于传感器的检测,颜色检测,基于金纳米颗粒的检测,荧光偏振,荧光信号,胶体相变,电化学检测或基于半导体的检测。
6.一种用于检测或诊断待测动物是否感染口蹄疫的系统、组合物或试剂盒,所述系统、组合物或试剂盒包括V型Cas蛋白、权利要求1所述的gRNA和单链核酸检测器。
7.一种检测/诊断口蹄疫病毒或者口蹄疫的系统、组合物或试剂盒,所述系统、组合物或试剂盒包括权利要求1所述的gRNA,所述系统、组合物或试剂盒还包括V型Cas蛋白以及单链核酸检测器。
8.权利要求7所述的组合物在诊断或检测口蹄疫中的用途,或者在用于制备诊断或检测口蹄疫的试剂或试剂盒中的用途。
9.权利要求7所述的组合物在检测或诊断口蹄疫病毒中的用途,或者在制备检测或诊断口蹄疫病毒的试剂或试剂盒中的用途。
10.根据权利要求8或9所述的用途,其特征在于,所述检测或诊断的待测样品来源于动物。
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