[发明专利]用于抑郁症筛查诊断标志物、装置、方法及介质

说明书

本发明属于生物技术领域，公开了用于抑郁症筛查诊断标志物、装置、方法及介质。所述标志物包括两组基因集的甲基化位点：第一组基因集包括：ENTPD3、ITGA4、KRT83、LAPTM4B、LIN54、NEFL、NUP133、OTOS、PNLDC1、PSCA、RALA和SOX14，第二组基因集包括：DCC、DHRS7C、ECHDC3、NKX2‑6、RAB4A、SIGIRR、SYT12、TCTN1、WDR89、C6orf72和FLJ20184；所述第一组基因集的DNA甲基化特征值和所述第二组基因集的DNA甲基化特征值用于计算甲基化抑郁指数。

技术领域

本发明属于生物技术领域，更具体而言涉及用于抑郁症筛查诊断标志 物、装置、方法及介质。

背景技术

根据世界卫生组织WHO发布的报告，抑郁症是人类第二大死亡原因、 首要致残原因。目前，全球抑郁症患者3.5亿人，我国成年人的终身患病率 为6.9％，抑郁症患者的自杀率约为10％-15％，因抑郁自杀是15岁至29岁 人群第二大死因。我国的抑郁症诊疗领域存在“三高三低”的特点，“三 高”即高发病率、高复发率、高自杀率；“三低”即低知晓率、低就诊率、 低治疗率。

目前，抑郁症的诊断主要面临的问题是诊断缓慢、困难并且主观。目前， 还没有任何可靠的生物标记可以用来诊断精神疾病；精神疾病的诊断依据主 要是国际疾病分类、精神障碍诊断与统计手册，需要有经验的医生依据调查 问卷和自己的经验进行判断。通过医生的询问观察及量表，易受主观因素影 响，而且由于缺乏客观的辅助诊断手段，在治疗、康复过程中不能实时监测 病情的发展变化，无法实现精准评价疗效，更无法做到精准分型、个性化治 疗。近年来在癌症等领域迅速发展的精准医学、个体化诊疗，在抑郁症领域 发展缓慢。目前，国际上已有研究在探索基于脑电、心电、肌电等生理指标， 对精神健康状态进行评估的技术。这些技术能够识别个体情感、压力水平、 情感障碍等因素的变化。但是对于与抑郁症发生、发展密切相关的生化、代 谢、炎症、基因网络等机理反映甚少。

因此，本领域中需要建立对抑郁状态进行量化、评估与分类的模型。

发明内容

本发明的目标在于建立基于DNA甲基化的抑郁特征的客观、量化评价 标记物、装置、方法和介质。

因此，在第一方面，本发明提供了一种用于抑郁症筛查诊断的标志物， 所述标志物包括两组基因集的甲基化位点：

第一组基因集包括：ENTPD3、ITGA4、KRT83、LAPTM4B、LIN54、 NEFL、NUP133、OTOS、PNLDC1、PSCA、RALA和SOX14，

第二组基因集包括：DCC、DHRS7C、ECHDC3、NKX2-6、RAB4A、 SIGIRR、SYT12、TCTN1、WDR89、C6orf72和FLJ20184；

其中所述第一组基因集的DNA甲基化特征值是抑郁症筛查诊断的正标 志物，所述第二组基因集的DNA甲基化特征值是抑郁症筛查诊断的负标志 物，

所述第一组基因集的DNA甲基化特征值和所述第二组基因集的DNA 甲基化特征值用于预测抑郁症。

在一个实施方案中，所述甲基化位点包括基因体gene body区域的甲基 化位点，优选还包括启动子区域promoter的甲基化位点。

在一个实施方案中，所述第一组基因集的DNA甲基化位点如表2所示。

在一个实施方案中，所述第二组基因集的DNA甲基化位点如表4所示。

在一个实施方案中，每个基因的甲基化特征值包括其基因体gene body 区位点的甲基化水平或它们均值，或者其基因体gene body区位点的甲基化 水平的均值与其启动子区位点的甲基化水平的均值的差值或SIMPO值。