[发明专利]一种用于检测胞内劳森菌的绝对荧光定量PCR引物对、试剂盒及检测方法在审
申请号: | 202110780216.4 | 申请日: | 2021-07-09 |
公开(公告)号: | CN113528683A | 公开(公告)日: | 2021-10-22 |
发明(设计)人: | 范红结;胡雨婷;李剑男;肖宁;周红;蔺辉星 | 申请(专利权)人: | 南京农业大学 |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/6851;C12Q1/06;C12N15/11 |
代理公司: | 南京中律知识产权代理事务所(普通合伙) 32341 | 代理人: | 沈振涛 |
地址: | 211225 江苏省南京市溧*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 检测 胞内劳森菌 绝对 荧光 定量 pcr 引物 试剂盒 方法 | ||
1.一种用于检测胞内劳森菌的绝对荧光定量PCR引物对,其特征在于,所述引物对包括上游引物和下游引物,其核酸序列如下所示:
上游引物:GCTGTGGATTGGGAGAAATC(SEQ ID NO.1);
下游引物:CAAGTTGACCAGCCTCTGC(SEQ ID NO.2)。
2.根据权利要求1所述的用于检测胞内劳森菌的绝对荧光定量PCR引物对,其特征在于,所述绝对荧光定量PCR引物对是根据猪源胞内劳森菌aspA基因序列,通过引物设计软件设计,并进行验证获得。
3.一种用于检测胞内劳森菌的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包含权利要求1所述的引物对。
4.一种检测胞内劳森菌的绝对荧光定量PCR方法,其特征在于,包括利用权利要求1所述的引物对,进行荧光定量PCR检测。
5.根据权利要求4所述的检测胞内劳森菌的绝对荧光定量PCR方法,其特征在于,所述绝对荧光定量PCR方法包括以下步骤:
(1)提取胞内劳森菌感染猪回肠样品中的基因组DNA;
(2)利用权利要求1所述的引物对,PCR扩增aspA基因;
(3)利用步骤(2)扩增所得目的基因片段,构建重组阳性质粒aspA-pMD18-T/DH5α;
(4)以构建的aspA-pMD19-T/DH5α重组质粒作为阳性标准品,进行qPCR反应,制备标准曲线;
(5)提取待测样品基因组DNA,随后以其为模板进行qPCR反应,反应体系同步骤(4),将得到的CT值代入步骤(4)所得标准曲线,从而计算出待测样品中胞内劳森菌的基因拷贝数。
6.根据权利要求5所述的检测胞内劳森菌的绝对荧光定量PCR方法,其特征在于,步骤(2)中,利用权利要求1所述的引物对PCR扩增aspA基因,反应体系包括:2×Taq Mix、ddH2O、权利要求1所述引物对、DNA模板;反应程序为:92-98℃预变性4-6min,92-98℃变性25-35s,50-60℃退火25-30s,68-74℃延伸0.5-1.5min,共28-32个循环,68-74℃延伸8-12min。
7.根据权利要求5所述的检测胞内劳森菌的绝对荧光定量PCR方法,其特征在于,步骤(4)中,所述标准曲线的制备方法包括如下:
标准品的浓度可按下列公式折算为拷贝数:
提取阳性重组质粒aspA-pMD19-T/DH5α后测定浓度,换算成拷贝数,并10倍比连续稀释5个稀释倍数,作为标准阳性模板进行qPCR反应,反应结束后,以标准品的CT值为横坐标,标准品的拷贝数的Log值为纵坐标,进行线性拟合,绘制标准曲线。
8.根据权利要求5所述的检测胞内劳森菌的绝对荧光定量PCR方法,其特征在于,步骤(4)中,所述qPCR反应的反应体系包括:模板,权利要求1所述引物对,ROXReferenceDyeⅡ,2×SYBRGreenIMix,ddH2O;程序包括:92-98℃预变性25-35s,92-98℃变性4-6s,55-65℃退火28-32s,反应程序共38-42个循环。
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