[发明专利]一种鳜鱼耐低氧性状相关SNP分子标记及其应用有效
| 申请号： | 202110784484.3 | 申请日： | 2021-07-12 |
| 公开（公告）号： | CN113502336B | 公开（公告）日： | 2022-12-02 |
| 发明（设计）人： | 丁炜东;曹丽萍;曹哲明;邴旭文 | 申请（专利权）人： | 中国水产科学研究院淡水渔业研究中心 |
| 主分类号： | C12Q1/6888 | 分类号： | C12Q1/6888;C12N15/11 |
| 代理公司： | 南京经纬专利商标代理有限公司 32200 | 代理人： | 曹翠珍 |
| 地址： | 214000 江苏省无锡*** | 国省代码： | 江苏;32 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 一种 鳜鱼 低氧 性状 相关 snp 分子 标记 及其 应用 | ||
1.一种用于检测鳜鱼耐低氧性状相关SNP分子标记的引物对，其特征在于，所述鳜鱼耐低氧性状相关SNP分子标记包括分子标记SNP1和分子标记SNP2；所述分子标记SNP1位于如SEQ ID NO.1所示核苷酸序列自5’端起的第1919位，该处碱基为T或C；所述分子标记SNP2位于如SEQ ID NO.1所示核苷酸序列自5’端起的第4784位，该处碱基为T或C；
所述引物对包括用于检测分子标记SNP1的引物对和用于检测分子标记SNP2的引物对；
所述用于检测分子标记SNP1的引物对，其上游引物和下游引物分别具有SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.3所示的核苷酸序列；
所述用于检测分子标记SNP2的引物对，其上游引物和下游引物分别具有SEQ ID NO.4和SEQ ID NO.5所示的核苷酸序列。
2.一种用于检测鳜鱼耐低氧性状相关SNP分子标记的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒中含有如权利要求1所述的引物对。
3.权利要求1所述引物对或权利要求2所述试剂盒在鳜鱼选育中的应用。
4.一种检测鳜鱼耐低氧性状的方法，其特征在于，通过对待测鳜鱼进行如权利要求1所述鳜鱼耐低氧性状相关SNP分子标记的检测，确定待测鳜鱼的耐低氧能力。
5.根据权利要求4所述的一种检测鳜鱼耐低氧性状的方法，其特征在于，包括以下步骤：
步骤1)提取待测鳜鱼尾鳍DNA；
步骤2)基于权利要求1所述的引物对或权利要求2所述的试剂盒，对待测鳜鱼的基因组DNA进行PCR扩增，以获得PCR扩增产物；
步骤3)对PCR扩增产物进行测序，基于测序结果，确定SNP分子标记的基因型；
步骤4)通过基因型确定待测鳜鱼的耐低氧能力：
所述分子标记SNP1位点的TT基因型个体的耐低氧性状显著高于TC基因型个体；所述分子标记SNP2位点的TC基因型个体的耐低氧性状显著高于TT基因型个体。
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