[发明专利]用于扩增或检测人腺病毒DNA的引物组及其应用在审
申请号: | 202110786504.0 | 申请日: | 2021-07-12 |
公开(公告)号: | CN113416798A | 公开(公告)日: | 2021-09-21 |
发明(设计)人: | 张其威;张静;吴建国 | 申请(专利权)人: | 暨南大学 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6858;C12N15/11;C12R1/93 |
代理公司: | 北京金智普华知识产权代理有限公司 11401 | 代理人: | 张晓博 |
地址: | 510632 广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 扩增 检测 病毒 dna 引物 及其 应用 | ||
1.用于扩增或检测人腺病毒DNA的引物组,其特征在于,包括针对Penton基因设计的第一引物对、针对Hexon基因设计的第二引物对和针对Fiber基因设计的第三引物对;
所述第一引物对包括:Penton-F如SEQ ID NO.1所示,Penton-R和如SEQ ID NO.2所示;
所述第二引物对包括:Hexon-F如SEQ ID NO.3所示,Hexon-R如SEQ ID NO.4所示;
所述第三引物对包括:Fiber-F如SEQ ID NO.5所示,Fiber-R如SEQ ID NO.6所示,Fiber-CR如SEQ ID NO.7所示。
2.如权利要求1所述的引物组,其特征在于,所述引物组用于对人腺病毒进行分型,所述分型的基因型包括对B、C、D和E型人腺病毒。
3.包括权利要求1或2所述的引物组的人腺病毒DNA扩增的反应体系。
4.如权利要求3所述的反应体系,其特征在于,还包括rTaq DNA聚合酶、Mg2+和dNTPs中的至少一种。
5.利用权利要求1或2所述的引物组、或者权利要求3或4所述的反应体系进行扩增或检测人腺病毒DNA分子的方法。
6.如权利要求5所述的方法,其特征在于,分别利用所述第一引物对、所述第二引物对和所述第三引物对进行PCR扩增;
使用所述第一引物对进行扩增反应的条件为:94℃条件下预变性2min,94℃变性30s,55℃退火30s,72℃延伸80s,扩增循环次数为35~40次,72℃延伸10min;
使用所述第二引物对进行扩增反应的条件为:94℃条件下预变性2min,然后94℃变性30s,53℃退火30s,72℃延伸100s,扩增循环次数为35~40次,72℃延伸10min;
使用所述第三引物对进行扩增反应的条件为:94℃条件下预变性2min,然后94℃变性30s,52℃退火30s,72℃延伸60s,扩增循环次数为35~40次,72℃延伸10min。
7.如权利要求6所述的方法,其特征在于,还包括对依据扩增反应判断待测样品中是否存在目标DNA分子的步骤;所述步骤包括:
当使用所述第一引物对进行扩增时,其扩增产物经电泳检测出现1.2kb条带时为阳性,不出现条带或者只出现片段小于100bp的引物二聚体条带时为阴性;
当使用所述第二引物对进行扩增时,其扩增产物经电泳检测出现1.6kb条带时为阳性,不出现条带或者只出现片段小于100bp的引物二聚体条带时为阴性;
当使用所述第三引物对进行扩增时,其扩增产物电泳检测出现1.0kb、1.5kb或2.0kb条带时为阳性,不出现条带或者只出现片段小于100bp的引物二聚体条带时为阴性。
8.权利要求1或2所述的引物组、或者权利要求3或4所述的反应体系在制备检测或分型人腺病毒试剂盒中的应用。
9.利用权利要求5-7任一项所述的方法对人腺病毒进行基因分型的方法。
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