[发明专利]基于核苷酸合成测序图谱的微生物种群鉴定方法及应用在审

专利信息
申请号: 202110798061.7 申请日: 2021-07-15
公开(公告)号: CN113403372A 公开(公告)日: 2021-09-17
发明(设计)人: 吴友菊;韦红;万逸 申请(专利权)人: 海南微氪生物科技股份有限公司
主分类号: C12Q1/6869 分类号: C12Q1/6869;C12Q1/04
代理公司: 海口翔翔专利事务有限公司 46001 代理人: 莫臻
地址: 570000 海南省海口市南海大道266*** 国省代码: 海南;46
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摘要:
搜索关键词: 基于 核苷酸 合成 图谱 微生物 种群 鉴定 方法 应用
【权利要求书】:

1.一种基于核苷酸合成测序图谱的微生物种群鉴定方法,其特征在于,

通过对微生物的目标片段进行三核苷酸和单核苷酸循环的测序反应,得到测序图谱,根据测序图谱绘制比色带,通过分析比色带或/和测序图谱确定微生物种类;

所述三核苷酸为dATPαS、dCTP、dTTP、dGTP中的任意三种核苷酸;

所述单核苷酸为不包括在三核苷酸中的另一核苷酸。

2.根据权利要求1所述的基于核苷酸合成测序图谱的微生物种群鉴定方法,其特征在于,具体包括以下步骤:

(1)提取微生物的DNA模板,并在聚合酶的作用下PCR扩增部分可变区;

(2)将扩增产物与测序引物结合;

(3)交替循环加入三核苷酸和单核苷酸进行焦磷酸测序,得到测序图谱;

(4)根据测序图谱绘制比色带;

(5)由比色带或/和测序图谱分析微生物种群。

3.根据权利要求1所述的基于核苷酸合成测序图谱的微生物种群鉴定方法,其特征在于,所述测序图谱包括由核苷酸数目、核苷酸种类、信号强度以及三核苷酸和单核苷酸的位置排布构成的全部信息。

4.根据权利要求1所述的基于核苷酸合成测序图谱的微生物种群鉴定方法,其特征在于,所述测序图谱的分析方法包括:

通过分析单核苷酸的位点确定微生物的种类。

5.根据权利要求1所述的基于核苷酸合成测序图谱的微生物种群鉴定方法,其特征在于,所述比色带包括依次设置的若干单元,一单元对应一核苷酸位点;所述三核苷酸所占单元位标记为区域A,所述单核苷酸所占单元位标记为区域B。

6.根据权利要求5所述的基于核苷酸合成测序图谱的微生物种群鉴定方法,其特征在于,比色带的分析方法包括:

将微生物的比色带与相似比色带叠加设置,根据重合程度确定微生物种类。

7.一种基于核苷酸测序图谱的微生物种群鉴定方法的应用,其特征在于,权利要求1-6任一项所述的微生物种群鉴定方法应用于定向突变位点的测序。

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