[发明专利]基于核苷酸合成测序图谱的微生物种群鉴定方法及应用在审
申请号: | 202110798061.7 | 申请日: | 2021-07-15 |
公开(公告)号: | CN113403372A | 公开(公告)日: | 2021-09-17 |
发明(设计)人: | 吴友菊;韦红;万逸 | 申请(专利权)人: | 海南微氪生物科技股份有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6869 | 分类号: | C12Q1/6869;C12Q1/04 |
代理公司: | 海口翔翔专利事务有限公司 46001 | 代理人: | 莫臻 |
地址: | 570000 海南省海口市南海大道266*** | 国省代码: | 海南;46 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 核苷酸 合成 图谱 微生物 种群 鉴定 方法 应用 | ||
1.一种基于核苷酸合成测序图谱的微生物种群鉴定方法,其特征在于,
通过对微生物的目标片段进行三核苷酸和单核苷酸循环的测序反应,得到测序图谱,根据测序图谱绘制比色带,通过分析比色带或/和测序图谱确定微生物种类;
所述三核苷酸为dATPαS、dCTP、dTTP、dGTP中的任意三种核苷酸;
所述单核苷酸为不包括在三核苷酸中的另一核苷酸。
2.根据权利要求1所述的基于核苷酸合成测序图谱的微生物种群鉴定方法,其特征在于,具体包括以下步骤:
(1)提取微生物的DNA模板,并在聚合酶的作用下PCR扩增部分可变区;
(2)将扩增产物与测序引物结合;
(3)交替循环加入三核苷酸和单核苷酸进行焦磷酸测序,得到测序图谱;
(4)根据测序图谱绘制比色带;
(5)由比色带或/和测序图谱分析微生物种群。
3.根据权利要求1所述的基于核苷酸合成测序图谱的微生物种群鉴定方法,其特征在于,所述测序图谱包括由核苷酸数目、核苷酸种类、信号强度以及三核苷酸和单核苷酸的位置排布构成的全部信息。
4.根据权利要求1所述的基于核苷酸合成测序图谱的微生物种群鉴定方法,其特征在于,所述测序图谱的分析方法包括:
通过分析单核苷酸的位点确定微生物的种类。
5.根据权利要求1所述的基于核苷酸合成测序图谱的微生物种群鉴定方法,其特征在于,所述比色带包括依次设置的若干单元,一单元对应一核苷酸位点;所述三核苷酸所占单元位标记为区域A,所述单核苷酸所占单元位标记为区域B。
6.根据权利要求5所述的基于核苷酸合成测序图谱的微生物种群鉴定方法,其特征在于,比色带的分析方法包括:
将微生物的比色带与相似比色带叠加设置,根据重合程度确定微生物种类。
7.一种基于核苷酸测序图谱的微生物种群鉴定方法的应用,其特征在于,权利要求1-6任一项所述的微生物种群鉴定方法应用于定向突变位点的测序。
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