[发明专利]一种生物标志物及其在肝内胆管细胞癌预后预测中的应用

权利要求书

1.生物标志物在制备用于肝内胆管细胞癌预后预测产品中的应用，其特征在于，生物标志物为LIX1L、LINC01822、TUBA4A、AC023481.1、MFSD1、AC097173.1、FAM153B、STEAP2/STEAP2-AS1、CDKN2B、FAM205BP、GAD2、LETMD1、RASSF3、AC073592.4、GOLGA6B、ORC6、TMEM106A的基因区域的组合，其中，所述AC097173.1、STEAP2/STEAP2-AS1、RASSF3、AC073592.4、GOLGA6B的基因区域为增强子，所述MFSD1、FAM153B、GAD2、ORC6的基因区域为内含子，所述LIX1L、TUBA4A的基因区域为外显子，所述LINC01822的基因区域为启动子，所述TMEM106A的基因区域为5’非翻译区，所述AC023481.1、CDKN2B、FAM205BP的基因区域为5’非翻译区或外显子，所述LETMD1的基因区域为3’非翻译区或外显子；

检测所述生物标志物的甲基化水平，基于所述甲基化水平计算基因组甲基化评分，根据所述基因组甲基化评分进行肝内胆管细胞癌预后。

2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述LIX1L的基因区域为chr1:145957635-145958017，LINC01822的基因区域为chr2: 21710623-21712623，TUBA4A的基因区域为chr2: 219251586-219251713，AC023481.1的基因区域为chr3: 8365593-8365799，MFSD1的基因区域为chr3: 158804371-158805340，AC097173.1的基因区域为chr4:119872612-119873113，FAM153B的基因区域为chr5: 176114061-176115592，STEAP2/STEAP2-AS1的基因区域为chr7: 90178863-90179364，CDKN2B的基因区域为chr9:22005202-22006271，FAM205BP的基因区域为chr9: 34838349-34838586，GAD2的基因区域为chr10: 26223977-26224538，LETMD1的基因区域为chr12: 51056370-51056502，RASSF3的基因区域为chr12: 64671189-64671690，AC073592.4的基因区域为chr12: 124626183-124626684，GOLGA6B的基因区域为chr15: 72237361-72237862，ORC6的基因区域为chr16:46689829-46690990，TMEM106A的基因区域为chr17: 43213020-43213041。

3.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述基因组甲基化评分的计算公式为：GMS= ，其中，N为用于计算基因组甲基化评分的基因区域数量，为第i个基因区域的甲基化水平，为第i个基因区域的系数，i=1,2,…,N；

GMS=(-2.21)*chr1:145957635-145958017+(-0.35)*chr2:21710623-21712623+(-0.47)*chr2: 219251586-219251713+(-0.25)*chr3:8365593-8365799+(-0.23)*chr3:158804371-158805340+0.64*chr4:119872612-119873113+(-0.57)*chr5:176114061-176115592+(-0.62)*chr7:90178863-90179364+(-0.88)*chr9:22005202-22006271+(-0.30)*chr9:34838349-34838586+(-0.48)*chr10:26223977-26224538+(-0.21)*chr12:51056370-51056502+(-0.28)*chr12:64671189-64671690+(-0.11)*chr12:124626183-124626684+(-0.54)*chr15:72237361-72237862+(-15.04)*chr16:46689829-46690990+(-0.73)*chr17:43213020-43213041。