[发明专利]基于甲基化的乳腺癌风险预测标志物、装置、方法及介质

说明书

本发明属于生物技术领域，公开了基于甲基化的乳腺癌风险预测诊断标志物、装置、方法及介质。所述标志物包括两组基因集的甲基化位点和血细胞组分：第一组基因集包括：第一组基因集包括：ENTPD3、ITGA4、KRT83、LAPTM4B、LIN54、NEFL、NUP133、OTOS、PNLDC1、PSCA、RALA和SOX14，第二组基因集包括：DCC、DHRS7C、ECHDC3、NKX2‑6、RAB4A、SIGIRR、SYT12、TCTN1、WDR89、C6orf72和FLJ20184，所述血细胞组分包括T细胞比例、B细胞比例、NK细胞比例、淋巴细胞比例、单核细胞比例、粒细胞比例、CD4阳性细胞比例、CD8阳性细胞比例。

技术领域

本发明属于生物技术领域，更具体而言涉及基于甲基化的乳腺癌风险预测标志物、装置、方法及介质。

背景技术

一般认为，乳腺癌的发生与压力、焦虑和抑郁等心理因素有关。一项前瞻性研究表明，抑郁症患者患乳腺癌的可能性是无抑郁症患者的4.078倍(P＝0.03)(A ProspectiveStudy of the Relationship between Psychological Factors and BreastCancer.Asia Pac J Oncol Nurs.2016；3(2):170-175.PMID:27981155)。但是，在过去三十年的研究中，抑郁症和乳腺癌的发生之间的关系出现了相互矛盾的结果。一项meta分析发现，有12项研究发现抑郁与乳腺癌的发展之间存在正相关，但3项研究发现了负相关。关于抑郁症和乳腺癌发病率之间的预测关系，研究结果显示：(a)使用较长时间框架的研究比使用较短时间框架的研究发现了更强的关联性；(b)使用不包含躯体项目的抑郁量表的研究比使用包含这些项目的抑郁量表的研究发现了更小的关联性。该文的结论认为，抑郁测量的量表选择是造成不确定性的重要方法学因素(Depression as a risk factor forbreast cancer:investigating methodological limitations in theliterature.Cancer Causes Control.2012Aug；23(8):1223-9.PMID:22706674)。

抑郁症诊断的客观性，目前还面临重要挑战。目前，还没有任何可靠的生物标记可以用来诊断精神疾病；精神疾病的诊断依据主要是国际疾病分类、精神障碍诊断与统计手册，需要有经验的医生依据调查问卷和自己的经验进行判断。通过医生的询问观察及量表，易受主观因素影响，而且由于缺乏客观的辅助诊断手段，在治疗、康复过程中不能实时监测病情的发展变化，无法实现精准评价疗效，更无法做到精准分型、个性化治疗。因此，基于心理问卷量表的抑郁测量方式，是基于抑郁等心理特征进行癌症疾病风险预测控制的重要技术瓶颈。

因此，本领域需要建立对抑郁状态进行客观量化的技术，建立基于抑郁量化状态的乳腺癌综合模型。

发明内容

本发明的目标在于建立基于DNA甲基化的乳腺癌特征的客观、量化评价装置、方法和介质。

因此，在第一方面，本发明提供了基于甲基化的乳腺癌风险预测标志物，所述标志物包括两组基因集的甲基化位点和血细胞组分：

第一组基因集包括：ENTPD3、ITGA4、KRT83、LAPTM4B、LIN54、NEFL、NUP133、OTOS、PNLDC1、PSCA、RALA和SOX14，

第二组基因集包括：DCC、DHRS7C、ECHDC3、NKX2-6、RAB4A、SIGIRR、SYT12、TCTN1、WDR89、C6orf72和FLJ20184；

其中所述第一组基因集的DNA甲基化特征值是抑郁症筛查诊断的正标志物，所述第二组基因集的DNA甲基化特征值是抑郁症筛查诊断的负标志物，

所述第一组基因集的DNA甲基化特征值和所述第二组基因集的DNA甲基化特征值用于预测抑郁症，