[发明专利]识别MBOAT2的TCR

说明书

本发明公开了一种识别MBOAT2的TCR，其是首例能够识别MBOAT2p.R43Q突变产生的新生抗原的TCR。针对MBOAT2p.R43Q突变产生的新生抗原,正常氨基酸序列为AAIWFRTYL，新生抗原氨基酸序列为AAIWFQTYL，抗原呈递分子为HLA‑C03:04，发明了一种能够特异性识别MBOAT2p.R43Q突变的TCR，其可以用于基因编辑改造T细胞，改造过的T细胞能够特异性识别含有该突变的肿瘤新生抗原，进而可以用于TCR‑T疗法，杀死肿瘤细胞。

技术领域

本发明涉及免疫疗法领域，更具体地说，它涉及识别MBOAT2突变产生的新生抗原的TCR。

背景技术

恶性肿瘤，作为中国居民死亡主要原因之一，发病率以每年3.9％的增幅增长，死亡率保持每年2.5％的增幅。全国每年有超300万人确诊患有癌症，平均每天确诊超过1万人。中国癌症高发病前十的恶性肿瘤，均为实体肿瘤。

过继性免疫细胞技术，以利用人体免疫系统杀伤癌细胞、病原体为目的，一般先采集病患自身T细胞，在体外扩增自体T细胞和/或优化该T细胞靶向性后，再向病患回输抗癌能力增强的T细胞；因为以自体T细胞为底物，所以相较传统疗法，过继性免疫细胞技术具有低毒副作用、低耐药性等优势。其中，针对肿瘤新生抗原的TCR-T疗法，被认为是能够攻克实体肿瘤最有效的治疗手段之一。

MBOAT2(膜结合O-酰基转运酶结构域2)基因编码一种催化将酰基辅酶中的酰基转运到水解磷脂的酰基转运酶，参与磷脂重构通路中的再酰化过程。在大鼠食道鳞状细胞癌模型中的研究发现，MBOAT2是miR-31的靶基因之一，而miR-31是在包括结直肠癌、食道癌等多种类型的肿瘤中最常见的过表达并致癌的microRNA之一。近年来有研究发现，MBOAT2基因位点同时转录一段环状RNA circMBOAT2，其在结直肠癌样本中及患者血清中高度表达并与肿瘤分期及预后相关，可以作为潜在的结直肠癌生物标志物。根据TCGA的数据，MBOAT2p.R43Q突变发生频率较高的肿瘤类型包括直肠癌(2.2％)和子宫内膜癌(1.1％)。

发明内容

应用基因编辑技术，改造的含有本发明的识别MBOAT2的TCR组合的T细胞，可以特异性杀伤通过HLA-C03:04呈递抗原肽AAIWFQTYL的细胞，其可以用于TCR-T疗法的开发应用。

为实现上述目的，本发明提供了如下技术方案：

在一个方面，本发明提供了识别MBOAT2的TCR，其包括TCRα链和TCRβ链；其中，TCRα链包括互补决定区CDR3，CDR3与选自SEQ ID NO:3的氨基酸序列具有至少70％的序列同一性，TCRβ链包括互补决定区CDR3，CDR3与选自SEQ ID NO:6的氨基酸序列具有至少70％的序列同一性。

至少70％的序列同一性：包括至少70％、71％、72％、73％、74％、75％、76％、77％、78％、79％、80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％、100％的序列同一性。

在一些实施方案中，所述TCRα链包括三个互补决定区CDR1、CDR2和CDR3，其中CDR1选自SEQ ID NO:1，CDR2选自SEQ ID NO:2，CDR3选自SEQ ID NO:3。

在一些实施方案中，所述TCRα链还包括四个框架区FR1、FR2、FR3和FR4，其中FR1选自SEQ ID NO:7，FR2选自SEQ ID NO:8，FR3选自SEQ ID NO:9，FR4选自SEQ ID NO:10。

在一些实施方案中，所述的识别MBOAT2的TCR，所述TCRβ链包括三个互补决定区CDR1、CDR2和CDR3，其中CDR1选自SEQ ID NO:4，CDR2选自SEQ ID NO:5，CDR3选自SEQ IDNO:6