[发明专利]一种用于二代测序文库构建方法及试剂盒在审
申请号: | 202110816778.X | 申请日: | 2021-07-20 |
公开(公告)号: | CN113699213A | 公开(公告)日: | 2021-11-26 |
发明(设计)人: | 黄必胜;胡咏武 | 申请(专利权)人: | 优葆优保健康科技(宁波)有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6806 | 分类号: | C12Q1/6806;C12N15/10;C40B50/06 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 315000 浙江省宁波*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 二代 序文 构建 方法 试剂盒 | ||
1.一种用于二代测序文库构建方法,其特征在于,包括如下步骤:
步骤1:提取需要测序的基因组DNA,包含但不限于各种肿瘤组织DNA,或外周血游离DNA(孕妇外周血或正常人或肿瘤患者外周血DNA)或各种体液,如但不限于胸腔积水、尿液,唾液等中的DNA。
步骤2:设计包含特异目标序列引物的,同时带有样本标记序列(index)和测序引物的引物序列,并人工合成该引物;
步骤3:将所述特异性引物和待测DNA混合,进行PCR扩增;
步骤4:纯化PCR产物;
步骤5:上机测序;
其中步骤2中使用的引物序列还包括SEQ ID NO:1所示的单链DNA与核苷酸序列如SEQID NO:2所示的单链DNA的退火产物作为所述接头,所述SEQ ID NO:1(A+B):5'-GATCGGAAGAGCTCGTATGCCGTCTTCTGCTTG(X1)m-3',所述SEQ ID NO:2(D+E+F):5'-CAAGCAGAAGACGGCATACGAGAT(N)n(X2)m-3';
其中所述SEQ ID NO:1(A+B)中(X1)m被设计成与被检测的目标序列位点附近上游引物;所述SEQ ID NO:2(D+E+F)中(N)n为标签序列,用于区分来自不同样本的测序数据,n为6~12的正整数,n个N彼此独立地选自A、T、C、G,(X2)m为下游引物,m为20-40的正整数,距离该位点1~50bp,例如2~20bp的目标序列特异性引物。
2.根据权利要求1所述的一种用于二代测序文库构建方法,其特征在于:所述步骤3中PCR反应体系为DNA20ul、PCR引物混合物5ul和PCR主混合物25ul。
3.根据权利要求1所述的一种用于二代测序文库构建方法,其特征在于:所述步骤4中对产物进行纯化的步骤,可以采用本领域熟知的磁珠法或滤膜吸附法试剂盒。
4.根据权利要求1所述的一种用于二代测序文库的试剂盒,其特征在于:所述上下游引物具体可以是,但不限于核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示的单链DNA与核苷酸序列如SEQ IDNO:2所示的单链DNA,或者它们的退火产物。
5.根据权利要求4所述的一种用于二代测序文库的试剂盒,其特征在于:还包括以下试剂:Taq酶,DNTP,MgCl2和PCR缓冲液。
6.根据权利要求4-5所述的一种用于二代测序文库的试剂盒,其特征在于:还包括磁珠法DNA纯化试剂盒或滤膜吸附法DNA纯化试剂盒。
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