[发明专利]与油茶种子油中软脂酸含量相关的DNA片段、其紧密连锁的SNP分子标记及其应用

权利要求书

1.与油茶种子油中软脂酸含量紧密连锁的SNP分子标记，其特征在于，包括SNP分子标记Chr11_39972457，其含有如SEQ ID NO.1所示序列第240位的多态性为C/A的核苷酸序列。

2.根据权利要求1所述的SNP分子标记，其特征在于，由序列如SEQ ID NO.2-3所示的引物对以油茶基因组DNA为模板经PCR扩增获得。

3.根据权利要求1或2所述的SNP分子标记，其特征在于，所述SNP分子标记Chr11_39972457中，具有所述多态性的位点的基因型为C/C，对应于高软脂酸含量；基因型为C/A，对应于低软脂酸含量。

4.用于扩增权利要求1~3任一项所述的SNP分子标记的引物，其特征在于，包括序列如SEQ ID NO.2-3所示的引物。

5.含有权利要求4所述的引物的试剂或试剂盒。

6.权利要求1~3任一项所述的SNP分子标记或权利要求4所述的引物或权利要求5所述的试剂或试剂盒的以下任一种应用：

（1）在鉴定油茶种子油脂中软脂酸含量表型中的应用；

（2）在油茶种子油脂中软脂酸含量改良或分子标记辅助育种中的应用；

（3）在油茶种子油脂中软脂酸含量的早期预测中的应用；

（4）在筛选高或低软脂酸含量油茶中的应用。

7.一种鉴定油茶种子油中软脂酸含量表型或筛选高软脂酸含量油茶种子的方法，其特征在于，包括如下步骤：

（1）提取待鉴定油茶的基因组DNA；

（2）以基因组DNA为模板，利用SEQ ID NO.2-3所示的引物进行PCR扩增；

（3）分析PCR扩增产物中权利要求1~3任一项所述的SNP分子标记的基因型，根据所述基因型判断待鉴定油茶的种子油中软脂酸含量表型。

8.根据权利要求7所述的方法，其特征在于，步骤（2）中，所述PCR扩增的反应程序为：94~95℃，3~5min；94~95℃，15~30s，65~69℃，40~60s，38~45个循环；67~70℃，3~6min。

9.根据权利要求7或8所述的方法，其特征在于，步骤（3）中，所述判断待鉴定油茶的种子油中软脂酸含量表型的方法为：

若SNP分子标记Chr11_39972457具有所述多态性的位点的基因型为C/C，则待鉴定油茶为高软脂酸含量；若基因型为C/A，则待鉴定油茶为低软脂酸含量。