[发明专利]一种gSSR分子标记及其党参真伪鉴定的方法在审
申请号: | 202110847070.0 | 申请日: | 2021-07-27 |
公开(公告)号: | CN113528701A | 公开(公告)日: | 2021-10-22 |
发明(设计)人: | 詹海仙;张丹;刘晓丽;张月荣 | 申请(专利权)人: | 山西中医药大学 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 山西五维专利事务所(有限公司) 14105 | 代理人: | 茹牡花 |
地址: | 030619 山西*** | 国省代码: | 山西;14 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 gssr 分子 标记 及其 党参 真伪 鉴定 方法 | ||
1.一种gSSR分子标记,其特征是,包括以下步骤:
(1)轮叶党参全基因组序列提取;
(2)SSR位点分析
利用MISA软件分析轮叶党参全基因组8条染色体上的SSR位点,软件设置标准为:basepair,bp 1、2、3、4、5、6bp,重复次数依次不少于10、6、5、5、5、5、5次,复合SSR小于100bp;
(3)gSSR引物设计
利用primer 5.0分别进行8条染色体上gSSR标记设计,并结合手动设计引物,引物的设计标准为:GC含量在30%~70%,产物的大小为100~250bp,Tm值在55℃~65℃之间,上下游引物Tm值差异为3~5℃,引物长度为18~25bp,引物GC含量30%~70%;
(4)步骤(3)gSSR引物分子标记得到6对引物序列如下:
2.使用gSSR分子标记对党参进行真伪鉴定的方法,其特征是:包括以下步骤:
(1)材料的收集和DNA提取
收集党参、银柴胡和家种防风三种材料,使用CTAB提取法提取基因组DNA,并用1%琼脂糖凝胶电泳检测DNA质量;并且CTAB提取法中的提取缓液为85度水浴预热;
(2)gSSR-PCR反应
gSSR-PCR反应总体系为10μL,包括1×Taq DNA聚合酶Buffer、25mM MgCl2、1.0U Taq酶、15mM dNTPs、gSSR标记上下游引物各0.15μM、DNA100 ng,双蒸水补齐到10μL;反应程序为94℃预变性5min,94℃变性1min、55℃复性45s、72℃延伸1.5min,34个循环,最后72℃延伸10min;
(3)党参gSSR-PCR反应电泳检测
取PCR产物3μL与等量6×上样液混匀,非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,180V恒压1h,银酸银染色;
(4)分析
从设计的引物中选取6对引物进行筛选,根据材料间扩增出特异条带的有无对党参及其伪品进行鉴定。
3.根据权利要求1所述gSSR分子标记在党参真伪鉴定中的应用。
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