[发明专利]用于山桐子遗传资源分析的SSR标记引物组及其应用

权利要求书

1.山桐子SSR标记引物组，其特征在于，包括6对SSR标记引物：

（1）IdS1：正向引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，反向引物的核苷酸序列如SEQID NO.2所示；

（2）IdS2：正向引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示，反向引物的核苷酸序列如SEQID NO.4所示；

（3）IdS3：正向引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示，反向引物的核苷酸序列如SEQID NO.6所示；

（4）IdS4：正向引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.7所示，反向引物的核苷酸序列如SEQID NO.8所示；

（5）IdS5：正向引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.9所示，反向引物的核苷酸序列如SEQID NO.10所示；

（6）IdS6：正向引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.11所示，反向引物的核苷酸序列如SEQID NO.12所示。

2.权利要求1所述的SSR标记引物组在山桐子遗传多样性分析和亲缘关系分析中的应用。

3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，包括以下步骤：

提取待测山桐子基因组DNA，以该基因组DNA为模板，用权利要求1所述的SSR标记引物组中的每对引物分别进行PCR扩增，然后对PCR产物进行电泳，根据电泳结果对山桐子进行遗传多样性分析和亲缘关系分析。

4.根据权利要求3所述的应用，其特征在于，所述的PCR扩增反应的体系为：100 ng模板DNA 1 μl，包含Taq DNA 聚合酶、Mg²⁺、dNTPs、指示染料和反应缓冲液的PCR预混液12.5 μl；10 μM正向引物和反向引物各0.5 μl；双蒸水补足至25 μl。

5.根据权利要求3所述的应用，其特征在于，所述PCR扩增反应的程序为：

以IdS1正向引物和反向引物进行PCR扩增反应时，为94 ℃预变性5 min；94 ℃变性30s，51.2℃退火45 s， 72℃延伸1min，32个循环；最后72 ℃延伸8 min；

以IdS2正向引物和反向引物进行PCR扩增反应时，为94 ℃预变性5 min；94 ℃变性30s，51.5℃退火45 s，72℃延伸1min，32个循环；最后72 ℃延伸8 min；

以IdS3正向引物和反向引物进行PCR扩增反应时，为94 ℃预变性5 min；94 ℃变性30s，56℃退火45 s，72℃延伸1min，32个循环；最后72 ℃延伸8 min；

以IdS4正向引物和反向引物进行PCR扩增反应时，为94 ℃预变性5 min；94 ℃变性30s，54.3℃退火45 s，72℃延伸1min，32个循环；最后72 ℃延伸8 min；

以IdS5正向引物和反向引物进行PCR扩增反应时，为94 ℃预变性5 min；94 ℃变性30s，51.6退火℃45 s，72℃延伸1min，32个循环；最后72 ℃延伸8 min；

以IdS6正向引物和反向引物进行PCR扩增反应时，为94 ℃预变性5 min；94 ℃变性30s，52.3℃退火45 s，72℃延伸1min，32个循环；最后72 ℃延伸8 min。