[发明专利]一种猪流行性腹泻病毒的3C样蛋白酶抑制剂及其筛选方法、以及其应用在审
申请号: | 202110855357.8 | 申请日: | 2021-07-28 |
公开(公告)号: | CN113621680A | 公开(公告)日: | 2021-11-09 |
发明(设计)人: | 李中华;侯永清;吴涛;张倩;易丹;赵迪;王蕾 | 申请(专利权)人: | 武汉轻工大学 |
主分类号: | C12Q1/37 | 分类号: | C12Q1/37;C12N15/85;C12N15/62;A61K45/00;A61K31/7048;A61P31/14;G16B50/00 |
代理公司: | 深圳市世纪恒程知识产权代理事务所 44287 | 代理人: | 高川 |
地址: | 430023 湖北省武*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 种猪 流行性 腹泻 病毒 蛋白酶 抑制剂 及其 筛选 方法 应用 | ||
1.一种猪流行性腹泻病毒的3C样蛋白酶抑制剂,其特征在于,所述3C样蛋白酶抑制剂包括诃子酸及其同分异构体、槲皮素-3-O-对香豆酰基鼠李糖葡萄糖苷、曲克芦丁、柠檬酸酯B、芹菜素-7-O-(2G-鼠李糖)龙胆糖苷、brutieridin、Heraclenol 3'-O-β-D-apiofuranosyl-(1→6)-β-D-glucopyranoside、Procyanidin B2 3,3'-di-O-gallate、柠檬酸酯A和苯甲酸苯甲醇葡萄糖酚苷中的至少一种。
2.一种如权利要求1所述的猪流行性腹泻病毒的3C样蛋白酶抑制剂的筛选方法,其特征在于,包括以下步骤:
S10、以猪流行性腹泻病毒的3C样蛋白酶为靶点,以小分子数据库为筛选对象,将所述小分子数据库中的所有分子与所述3C样蛋白酶的活性区域进行分子对接,筛选得到亲和力排名前50~150的天然分子;
S20、将筛选得到的所述天然分子在细胞外和/或细胞内进行生物活性筛选,得到3C样蛋白酶抑制剂;
其中,所述小分子数据库包括ZINC15数据库。
3.如权利要求2所述的猪流行性腹泻病毒的3C样蛋白酶抑制剂的筛选方法,其特征在于,所述小分子数据库为所述ZINC15数据库中的天然分子库。
4.如权利要求2所述的猪流行性腹泻病毒的3C样蛋白酶抑制剂的筛选方法,其特征在于,步骤S10包括:
S11、将所述小分子数据库中的所有分子与所述3C样蛋白酶的活性区域使用AutodockVina进行对接,初步筛选得到亲和力排名前9000~14000的初筛分子;
S12、再使用Discovery studio将所有所述初筛分子与所述3C样蛋白酶进行柔性对接,精筛得到亲和力排名前50~150的天然分子。
5.如权利要求2所述的猪流行性腹泻病毒的3C样蛋白酶抑制剂的筛选方法,其特征在于,步骤S20包括:
S21、用荧光共振能量转移系统检测3C样蛋白酶抑制剂在细胞外的活性;和/或,
S22、用双荧光酶报告系统检测3C样蛋白酶抑制剂在细胞内的活性。
6.如权利要求5所述的猪流行性腹泻病毒的3C样蛋白酶抑制剂的筛选方法,其特征在于,步骤S21包括:
S210、根据3C样蛋白酶切割猪流行性腹泻病毒的复制酶多聚蛋白ppla和pplb的位点,合成修饰多肽Dabcyl-YNSTLQ↓AGLRKM-E-Edans,所述修饰多肽可被3C样蛋白酶切割,以使E-Edans的荧光信号被释放出来;
S211、向所述修饰多肽加入所述3C样蛋白酶、所述3C样蛋白酶抑制剂和缓冲液,在340nm激发光条件下,检测480nm处的发射光强度,以检测所述3C样蛋白酶抑制剂的活性。
7.如权利要求5所述的猪流行性腹泻病毒的3C样蛋白酶抑制剂的筛选方法,其特征在于,步骤S22包括:
S220、将3C样蛋白酶切割多肽与萤火虫荧光素酶融合表达,并插入内含肽DnaE,得到环化报告质粒;
S221、将所述环化报告质粒、海肾荧光素酶质粒、以及表达所述3C样蛋白酶的质粒共转染293T细胞,转染后5~7h更换含有所述3C样蛋白酶抑制剂的维持液,转染后20~28h用双荧光素酶检测试剂盒检测3C样蛋白酶的切割活性。
8.一种抗猪流行性腹泻病毒的药物,其特征在于,所述药物的活性成分包括3C样蛋白酶抑制剂,所述3C样蛋白酶抑制剂为如权利要求1所述的猪流行性腹泻病毒的3C样蛋白酶抑制剂。
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