[发明专利]一种猪流行性腹泻病毒的3C样蛋白酶抑制剂及其筛选方法、以及其应用在审
申请号: | 202110855357.8 | 申请日: | 2021-07-28 |
公开(公告)号: | CN113621680A | 公开(公告)日: | 2021-11-09 |
发明(设计)人: | 李中华;侯永清;吴涛;张倩;易丹;赵迪;王蕾 | 申请(专利权)人: | 武汉轻工大学 |
主分类号: | C12Q1/37 | 分类号: | C12Q1/37;C12N15/85;C12N15/62;A61K45/00;A61K31/7048;A61P31/14;G16B50/00 |
代理公司: | 深圳市世纪恒程知识产权代理事务所 44287 | 代理人: | 高川 |
地址: | 430023 湖北省武*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 种猪 流行性 腹泻 病毒 蛋白酶 抑制剂 及其 筛选 方法 应用 | ||
本发明公开一种猪流行性腹泻病毒的3C样蛋白酶抑制剂及其筛选方法、以及其应用,其中,3C样蛋白酶抑制剂包括诃子酸及其同分异构体、槲皮素‑3‑O‑对香豆酰基鼠李糖葡萄糖苷、曲克芦丁、柠檬酸酯B、芹菜素‑7‑O‑(2G‑鼠李糖)龙胆糖苷、brutieridin、Heraclenol3'‑O‑β‑D‑apiofuranosyl‑(1→6)‑β‑D‑glucopyranoside、Procyanidin B23,3'‑di‑O‑gallate、柠檬酸酯A和苯甲酸苯甲醇葡萄糖酚苷中的至少一种。由于3C样蛋白酶在猪流行性腹泻病毒的转录、复制以及抗宿主细胞防御机制过程中发挥重要作用,因此,本发明提供的3C样蛋白酶抑制剂通过抑制猪PEDV3C样蛋白酶的活性,能够抑制猪流行性腹泻病毒感染宿主细胞,且抑制效果较好。进一步地,本发明提供的3C样蛋白酶抑制剂能够用来制备抗猪流行性腹泻病毒的药物,为上述分子开发了新的应用途径。
技术领域
本发明涉及抗病毒技术领域,特别涉及一种猪流行性腹泻病毒的3C样蛋白酶抑制剂及其筛选方法、以及其应用。
背景技术
猪流行性腹泻(porcine epidemic diarrhea,PED)是一种由猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)引起的高度接触性猪肠道传染病,以发病猪呕吐、水样腹泻、脱水为主要特征。PED对各年龄阶段的猪都会造成影响,尤其对7日龄以内的哺乳仔猪具有高致死性,病死率高达100%,是当前影响仔猪成活率和养猪生产的重要因素。疫苗是预防该病的有效手段,但疫苗无法为已感染的仔猪提供保护,且目前针对此病尚无治疗性药物。
发明内容
本发明的主要目的是提出一种猪流行性腹泻病毒的3C样蛋白酶抑制剂及其筛选方法、以及其应用,旨在提供一种能治疗猪流行性腹泻的3C样蛋白酶抑制剂。
为实现上述目的,本发明提出一种猪流行性腹泻病毒的3C样蛋白酶抑制剂,其中,所述3C样蛋白酶抑制剂包括诃子酸及其同分异构体、槲皮素-3-O-对香豆酰基鼠李糖葡萄糖苷、曲克芦丁、柠檬酸酯B、芹菜素-7-O-(2G-鼠李糖)龙胆糖苷、Heraclenol 3'-O-β-D-apiofuranosyl-(1→6)-β-D-glucopyranoside、brutieridin、Procyanidin B2 3,3'-di-O-gallate、柠檬酸酯A和苯甲酸苯甲醇葡萄糖酚苷中的至少一种。
进一步地,本发明还提出一种如上所述的猪流行性腹泻病毒的3C样蛋白酶抑制剂的筛选方法,所述筛选方法包括以下步骤:
S10、以猪流行性腹泻病毒的3C样蛋白酶为靶点,以小分子数据库为筛选对象,将所述小分子数据库中的所有分子与所述3C样蛋白酶的活性区域进行分子对接,筛选得到亲和力排名前50~150的天然分子;
S20、将筛选得到的所述天然分子在细胞外和/或细胞内进行生物活性筛选,得到3C样蛋白酶抑制剂;
其中,所述小分子数据库包括ZINC15数据库。
可选地,所述小分子数据库为所述ZINC15数据库中的天然分子库。
可选地,步骤S10包括:
S11、将所述小分子数据库中的所有分子与所述3C样蛋白酶的活性区域使用Autodock Vina进行对接,初步筛选得到亲和力排名前9000~14000的初筛分子;
S12、再使用Discovery studio将所有所述初筛分子与所述3C样蛋白酶进行柔性对接,精筛得到亲和力排名前50~150的天然分子。
可选地,步骤S20包括:
S21、用荧光共振能量转移系统检测3C样蛋白酶抑制剂在细胞外的活性;和/或,
S22、用双荧光酶报告系统检测3C样蛋白酶抑制剂在细胞内的活性。
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