[发明专利]一种X染色体STR基因座的复合扩增体系及试剂盒

说明书

本发明公开了一种X染色体STR基因座的复合扩增体系，包括特异性复合扩增32个X染色体STR基因座和1个Amelogenin性别识别基因座的33对引物对。还提供了含有上述复合扩增体系的试剂盒，可应用于法医个体识别、嫌疑人家系排查、产前诊断、X染色体数据库、和/或亲权鉴定。可单管同时扩增33个基因座，远超现有其他同类型复合扩增体系或试剂盒的上限。

技术领域

本发明涉及分析遗传学技术领域，特别涉及一种X染色体STR基因座的复合扩增体系及试剂盒。

背景技术

短串联重复序列(Short Tandem Repeat，STR)是存在于人基因组中的一类具有长度多态性的DNA序列，其核心序列一般由2～6个碱基构成，因该核心序列在不同个体间呈不同数目的串联重复而呈现出长度多态性。人基因组DNA中平均每6-10kb就有一个STR基因座，这些广泛分布于人基因组中高度多态重复序列成为个体识别和亲权鉴定的有效遗传标记。STR片段小易扩增，适宜于检验微量和降解生物检材，各基因座的扩增条件相似而能够实现复合扩增和自动化检测，因而具有灵敏、准确、快速、信息量大等优点，非常适用于建立DNA数据库。目前在法医工作中应用较多的方法包括常染色体检测和/或Y染色体检测。但在日常检案过程中，遇到母子、父女关系鉴定以及在双亲缺失的姐妹关系认定、同父异母的姐妹关系认定、祖母-孙女的关系认定时，则仅依靠现有的检测技术难以低成本、快速完成鉴定。

发明内容

本发明目的一方面在于提供一种X染色体STR基因座的复合扩增体系及试剂盒，以解决现有技术中所存在的一个或多个技术问题，提供至少一种有益的选择或创造条件。

一种X染色体STR基因座的复合扩增体系，包括反应混合液、热启动Taq酶、引物的混合物、sdH₂O，以及提取的待测DNA。其中所述引物对包括特异性复合扩增32个X染色体STR基因座和1个Amelogenin性别识别基因座的33对引物对，所述X染色体STR基因座选自DXS8378、DXS7423、DXS10148、DXS10159、DXS10134、DXS7424、DXS9902、DXS10162、DXS7132、DXS10079、DXS6789、GATA165B12、DXS101、DXS10075、DXS10103、DXS10101、HPRTB、DXS6809、GATA31E08、GATA172D05、DXS6803、DXS10074、DXS10135、DXS6810、Amelogenin、DXS6795、DXS6800、DXS7133、DXS10164、DXS6807、DXS9895、DXS8377及DXS981。

在进行二联体的检测时，在母子、父女关系鉴定中，X-STR比常染色体STR更加直观有效。尤其是父亲女儿的遗传关系鉴定中，可以很好的应用X染色体STR遗传标记。男性含有一条X染色体，X-STR以单倍型形式存在，其完全来源母亲且完全遗传给女儿。在母女遗传关系中，X染色体与常染色相同，不会发挥更多的作用。但在特殊案例中，比如，两人并非母女但常染色体并不能排除的情况下，加X染色体遗传标记有很好的排除作用。同样根据X染色体独特的遗传方式，X染色体STR在双亲缺失的姐妹关系认定，同父异母的姐妹关系认定，祖母-孙女的关系认定中起重要作用。X染色体STR由于其单个位点的位点平均排除率优于常染色体，在腐败降解检材检测中有一定作用，前面小片段的基因座能提供一定的信息。

所述X染色体STR基因座的复合扩增体系能够实现单管同时扩增检测33个基因座，因而能够用于X染色体基因座信息实现个体识别及嫌疑人的快速排查，又能用于产前诊断、和/或亲权鉴定，对于法医DNA的快速检验和现场检验能提供有效的技术保障。具体地，所选基因座的信息如表1所示：

表1、各基因座信息

在一些实施例中，所述特异性扩增引物的终浓度为0.025μm~0.51μm。具体的引物序列及浓度如表2所示：