[发明专利]一种判断种公猪精液质量的基因检测引物及判断方法在审
申请号: | 202110907141.1 | 申请日: | 2021-08-09 |
公开(公告)号: | CN113462788A | 公开(公告)日: | 2021-10-01 |
发明(设计)人: | 丁月云;殷宗俊;张晓东;郑先瑞;王彩云;吴旭东;曹邦基;陈琼;夏静;凌紫荆;侯银辉;孔诚诚 | 申请(专利权)人: | 安徽农业大学 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/6851;C12N15/11;G16B20/00 |
代理公司: | 北京双收知识产权代理有限公司 11241 | 代理人: | 王菊珍 |
地址: | 230031 安徽*** | 国省代码: | 安徽;34 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 断种 公猪 精液 质量 基因 检测 引物 判断 方法 | ||
1.一种判断种公猪精液质量的基因检测引物,其特征在于,检测引物包括如下序列:
HSF1基因引物对,其正向序列如SEQ ID NO.1所示,反向引物序列如SEQ ID NO.2;
VDAC2基因引物对,其正向序列如SEQ ID NO.3所示,反向引物序列如SEQ ID NO.4所示;
WIP1基因引物对,其正向序列如SEQ ID NO.5所示,反向引物序列如SEQ ID NO.6所示。
2.一种判断种公猪精液质量的方法,其特征在于:以精子密度、顶体完整率、精子活力、精子DNA完整率、精子线粒体活性作为精液质量正向指标。
3.权利要求2所述的判断种公猪精液质量的方法,其特征在于:该方法以候选基因HSF1基因、候选基因VDAC2和候选基因WIP1基因作为精液质量标记基因。
4.权利要求3所述的判断种公猪精液质量的方法,其特征在于:根据候选基因HSF1基因表达水平判断精子密度和顶体完整率;候选基因HSF1基因分别与精子密度和顶体完整率呈正相关;候选基因HSF1基因表达水平越高,精子密度和顶体完整率越高,在其他指标相同条件下,公猪精液质量越高。
5.权利要求3所述判断种公猪精液质量方法,其特征在于:根据候选基因VDAC2基因表达水平判断精子活力;候选基因VDAC2基因与精子活力呈正相关;候选基因VDAC2基因表达水平越高精子活力越强,在其他指标相同条件下,公猪精液质量越高。
6.权利要求3所述判断种公猪精液质量方法,其特征在于:根据候选基因WIP1基因表达量判断精子活力和精子线粒体活性;候选基因WIP1基因分别与精子活力和精子线粒体活性呈负相关;候选基因WIP1基因表达水平越低,精子活力和精子线粒体活性越高,在其他指标相同条件下,公猪精液质量越高;所述公猪为霍寿黑猪。
7.权利要求3所述判断种公猪精液质量方法,其特征在于:根据候选基因WIP1基因表达量判断精子活力和精子DNA完整率;候选基因WIP1基因分别与精子活力和精子DNA完整率呈负相关;候选基因WIP1基因表达水平越低,精子活力和DNA完整率越高,在其他指标相同条件下,公猪精液质量越高;所述公猪为杜洛克猪和长白猪。
8.权利要求2或5所述的判断种公猪精液质量方法,其特征在于:所述种公猪为霍寿黑猪;所述正向指标为精子活力。
9.权利要求2-8任一项所述的判断种公猪精液质量方法,其特征在于,该方法具体步骤为:(1)以精子密度、顶体完整率、精子活力、精子DNA完整率、精子线粒体活性作为精液质量正向指标;(2)以候选基因HSF1基因、候选基因VDAC2和候选基因WIP1基因作为精液质量标记基因;(3)根据候选基因设计PCR引物,其中,HSF1基因引物对,其正向序列如SEQ ID NO.1所示,反向引物序列如SEQ ID NO.2;VDAC2基因引物对,其正向序列如SEQ ID NO.3所示,反向引物序列如SEQ ID NO.4所示;WIP1基因引物对,其正向序列如SEQ ID NO.5所示,反向引物序列如SEQ ID NO.6所示;(4)提取种公猪精液中精子总RNA;(5)mRNA逆转录获取cDNA;(6)利用步骤(3)所示的PCR引物进行实时荧光定量PCR扩增;(7)对步骤(6)获得的PCR扩增产物进行基因表达水平比较;(8)候选基因HSF1基因、VDAC2基因水平越高,候选基因WIP1基因表达水平越低的种公猪精液质量越高。
10.一种种公猪精液质量候选基因的筛选方法,其特征在于,该方法具体步骤为:(1)精液质量指标选择:以精子活力、精子密度、精子活率、顶体完整率、精子质膜完整率、精子畸形率、精子DNA完整率、精子线粒体活性作为精液质量评价指标;(2)qRT-PCR引物设计:选择候选基因HSF1,设计其正向序列如SEQ ID NO.1所示,反向序列如SEQ ID NO.2;候选基因VDAC2,设计其正向序列如SEQ ID NO.3所示,反向序列如SEQ ID NO.4所示;候选基因WIP1,设计其正向序列如SEQ ID NO.5所示,反向序列如SEQ ID NO.6所示;候选基因P34H,设计其正向序列如SEQ ID NO.7所示,反向序列如SEQ ID NO.8所示;内参引物GAPDH,设计其正向序列如SEQ ID NO.9所示,其反向序列如SEQ ID NO.10所示;(3)试验动物选择:选择饲养条件完全一致、年龄段一致、健康状态良好的杜洛克、霍寿黑猪、长白猪种公猪,采集精液;(4)精液质量评价:将步骤(3)各种公猪的精液按照步骤(1)的评价指标进行评价;(5)cDNA模板获得:将步骤(3)获得的精液进行精子总RNA提取,进行逆转录;反应程序为:42℃15min,42℃30min,85℃5min;(6)qRT-PCR扩增,反应程序为:94℃30s,94℃5s,61℃35s,荧光检测1次,共40个循环,每个样本设置为3个重复;(7)数据统计分析:采用SPSS 25.0软件单因素方差分析程序分析品种间精液品质相关指标的差异,用SPSS 25.0软件Pearson相关性程序分析精液质量参数指标和基因表达的相关性;(8)种公猪精液质量候选基因选择:根据步骤(7)统计结果发现,HSF-1基因的表达与霍寿黑猪精子密度、顶体完整率呈显著正相关;VDAC2基因的表达与霍寿黑猪、杜洛克猪的精子活力均呈显著正相关;WIP1基因的表达与杜洛克种公猪的精子活力、DNA完整率呈显著负相关;WIP1基因的表达与霍寿黑猪种公猪的精子活力、精子线粒体活性呈显著负相关;WIP1基因的表达与长白猪种公猪的精子活力、DNA完整率呈显著负相关;P34H基因的与三种品种公猪精液质量无显著相关性;选择HSF-1、VDAC2和WIP1作为种公猪精液质量的候选基因。
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