[发明专利]m6A相关lncRNA在制备预测结直肠癌预后产品中的应用在审
申请号: | 202110928940.7 | 申请日: | 2021-08-13 |
公开(公告)号: | CN113502330A | 公开(公告)日: | 2021-10-15 |
发明(设计)人: | 练磊;熊志中;李宪哲;殷实;谢明颢 | 申请(专利权)人: | 中山大学附属第六医院 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;G16B20/00;G16B40/00 |
代理公司: | 广州三环专利商标代理有限公司 44202 | 代理人: | 陈旭红;晏静文 |
地址: | 510655 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | m6a 相关 lncrna 制备 预测 直肠癌 预后 产品 中的 应用 | ||
1.m6A相关lncRNA在制备预测结直肠癌预后产品中的应用。
2.根据权利要求1所述应用,其特征在于,
所述m6A相关lncRNA为AC087277.2、AC007991.4、AC008494.3、AC254629.1、AL121583.1中的一种或几种;
所述AC087277.2、AC007991.4、AC008494.3、AC254629.1、AL121583.1的序列为SEQ IDNo.1-5所示。
3.根据权利要求1所述应用,其特征在于,
所述结直肠癌为TNM分期为I期或II期的早期结直肠癌。
4.根据权利要求1所述应用,其特征在于,所述应用是通过检测所述m6A相关lncRNA的表达水平,从而预测结直肠癌预后。
5.根据权利要求4所述应用,其特征在于,
所述检测采用的试剂包括特异性扩增m6A相关lncRNA的引物或者特异性识别m6A相关lncRNA的探针;
所述产品包括试剂盒和芯片。
6.根据权利要求5所述应用,其特征在于,所述特异性扩增m6A相关lncRNA:AC087277.2、AC007991.4、AC008494.3、AC254629.1、AL121583.1的引物分别如SEQ IDNo.6-15所示。
7.一种预测结直肠癌预后的产品,其特征在于,包括检测离体结直肠癌组织样本中m6A相关lncRNA:AC087277.2、AC007991.4、AC008494.3、AC254629.1或AL121583.1表达水平的试剂。
8.根据权利要求7所述预测结直肠癌预后的产品,其特征在于,采用所述产品检测m6A相关lncRNA的表达水平之后,使用风险评分公式进行风险评分;其中,k为m6A相关lncRNA的数量,βi为每个m6A相关lncRNA的系数,Si为每个m6A相关lncRNA表达水平;
所述m6A相关lncRNA:AC087277.2、AC007991.4、AC008494.3、AC254629.1、AL121583.1的系数分别为–0.828、0.989、–5.396、–0.151、–1.435;
预测结直肠癌预后情况时,样本的风险评分高于界值0.0481则预后不良,风险评分低于界值0.0481则预后良好。
9.一种预测结直肠癌预后模型的构建方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)单因素Cox回归分析筛选获得与早期结直肠癌患者总生存期OS显著相关的m6A相关lncRNAs;
(2)将患者分为训练组和验证组,Lasson回归分析每个OS显著相关的m6A相关lncRNAs对生存期的贡献,建立风险评分模型;
(3)使用验证组对风险评分模型进行验证,检验所建模型的预测准确度。
10.采用权利要求9所述构建方法获得的预测早期结直肠癌预后模型为:风险评分=–0.828×AC087277.2的表达水平+0.989×AC007991.4表达水平–5.396×AC008494.3的表达水平–0.151×AC254629.1的表达水平–1.435×AL121583.1的表达水平;当风险评分大于0.0481时,患者预后不良;当风险评分小于0.0481时,患者预后良好。
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