[发明专利]一种三阴乳腺癌预后预测装置、预测模型及其构建方法

权利要求书

1.一种三阴乳腺癌预后预测模型构建方法，其特征在于：包括以下步骤：

S1、实现三阴乳腺癌样本原始基因表达数据和相应的临床生存数据的收集，并实现基因表达数据的标准化处理后，获得基因表达矩阵；

S2、获取三阴乳腺癌独立的成癌特异基因，并获取此类基因表达量；

S3、从获取的独立的成癌特异基因中筛选出构建预后预测模型的参数并获取对应的回归系数，所述参数为多个基因类型；

S4、基于筛选出的基因，根据其表达量和对应的回归系数，计算风险评分，得到三阴乳腺癌预后预测模型。

2.如权利要求1所述的一种三阴乳腺癌预后预测模型构建方法，其特征在于：所述步骤S1中， 基于UCSC-TCGA数据库实现三阴乳腺癌样本原始基因表达数据和相应的临床生存数据的收集，在收集过程中需去除临床数据不完整和总生存时间小于一个月的样本数据。

3.如权利要求1所述的一种三阴乳腺癌预后预测模型构建方法，其特征在于：所述步骤S3具体包括如下步骤：

S31、首先筛取成癌特异基因中的蛋白通路核心基因，然后实现蛋白通路核心基因的单因素COX分析，筛选与临床预后相关的预后核心基因；

S32、以筛选所得的预后核心基作为建立三阴乳腺癌独立的临床预测模型的参数，采用LASSO回归算法并采用交叉验证法根据方差最小确定最优调整参数λ，从而确定用于构建预测模型的最优变量；

所述LASSO回归算法具体为：LASSO目标函数＝残差平方和+λ*系数的绝对值之和，公式表达为：

其中，loss(w)是LASSO目标函数，yj是n*1观测向量，xji为预测变量，即预后核心基因，wi是系数；用交叉验证方法确定最优调整参数λ。

4.如权利要求1所述的一种三阴乳腺癌预后预测模型构建方法，其特征在于：所述的构建预后预测模型的参数包括ARL9，NCCRP1，SBSN，RERG，TPSB2，TPSAB1，C15orf59，GPR158，SRRM3，PSORS1C2，DSC2，SEPT3，PTPRN2，ALX3，KLHDC7A。

5.如权利要求1所述的一种三阴乳腺癌预后预测模型构建方法，其特征在于：所述三阴乳腺癌预后预测模型基于循环COX建立，具体表示为：I＝∑F*C；其中，I为风险评分，F为各模型基因的相对比值，C为各模型基因对应的回归系数。

6.一种三阴乳腺癌预后预测模型，其特征在于：该模型采用如权利要求1-5任一项所述的构建方法构建而成。

7.一种三阴乳腺癌预后预测装置，其特征在于：基于权利要求6所述的三阴乳腺癌预后预测模型实现，包括数据收集模块、模型基因类型分析模块、参数筛选模块、预后模型构建模块以及预测输出模块；所述数据收集模块用于收集三阴乳腺癌样本原始基因表达数据和相应的临床生存数据，并对收集的数据进行预处理和标准化；所述模型基因类型分析模块用于获取肿瘤组织内模型基因并计算各模型基因的相对比值；所述参数筛选模块用于从模型基因类型中筛选出用于构建预后预测模型的参数并获取相对应的回归系数；所述预后模型构建模块用于根据被选为参数的模型基因类型的相对比值及其对应的回归系数，计算风险评分，构建三阴乳腺癌预后预测模型；所述预测输出模块用于通过最大选择等级统计确定cutoff值，将得到的风险评分与cutoff值进行比较，输出被测患者的风险值。

8.如权利要求7所述的一种三阴乳腺癌预后预测装置，其特征在于：所述输出被测患者的风险值具体为，小于或等于cutoff值，被测患者属于低风险，大于cutoff值，被测患者属于高风险。