[发明专利]一种三阴乳腺癌预后预测装置、预测模型及其构建方法

说明书

本发明公开了一种三阴乳腺癌预后预测模型构建方法，包括以下步骤：实现三阴乳腺癌样本原始基因表达数据和相应的临床生存数据的收集，并实现基因表达数据的标准化处理后，获得基因表达矩阵；获取三阴乳腺癌独立的成癌特异基因，并获取此类基因表达量；从获取的独立的成癌特异基因中筛选出构建预后预测模型的参数并获取对应的回归系数，所述参数为多个基因类型；基于筛选出的基因，根据其表达量和对应的回归系数，计算风险评分，得到三阴乳腺癌预后预测模型。本发明构建的三阴乳腺癌预后预测模型，实现了三阴乳腺癌患者预后的风险分层，显著地将高低风险的患者分开，进而可以预测三阴乳腺癌的临床结果，指导个体化治疗，具有较高的临床应用价值。

技术领域

本发明涉及医疗领域，具体涉及一种三阴乳腺癌预后预测装置、预测模型及其构建方法。

背景技术

乳腺癌具有多种生物学行为、临床病理特点和分子特征各不相同的差异。根据临床诊断标记的差异将乳腺癌分为不同的分子亚型，包括管腔A型(1uminal subtype A)、管腔B／C型(1uminal subtype B／C)、正常乳腺样型(normal breast— like subtype)、HER一2过表达型(HER一2 over— expression subtype)以及基底细胞样型(basal—likesubtypel），不同亚型乳腺癌的临床特点、治疗反应性和预后均存在明显差异。

三阴性乳腺癌(tripie—negative breast cancer,TNBC)是乳腺癌中的一种临床病理类型，表现为雌激素受体(estrogen receptor,ER)、孕激素受体(progesteronereceptor,PR)和HER2／neu均无表达或呈低表达。它与基底细胞样型呈一定的交叉关系，大约有80％～90％的三阴性乳腺癌属于基底细胞样乳腺癌，也有少数的基底细胞样乳腺癌表达激素受体。

由于此类型乳腺癌缺乏有效的内分泌治疗和抗HER2／neu靶向治疗，临床上大多采用常规治疗手段，肿瘤具有局部复发和远处转移快，病死率高，预后差，治疗效果不佳的特点。且此类型的预后与肿瘤大小记忆淋巴结状况关系不大，复发相对迅速，1-3年是复发高峰。其组织学特征为导管基底样细胞来源，肿瘤的侵袭能力强，远处转移的风险性高，内脏转移几率较骨转移高，脑转移发生率也较高，3年之内为转移高峰，之后转移风险可能会有所下降，但其预后仍较差，死亡风险较高。对于三阴乳癌的治疗来说，一般综合性治疗比较常见，即运用临床的专业治疗同时在生活中进行辅助。近年来ICB治疗有了新的发展，虽对治疗三阴乳腺癌有一定效果，但从长期角度来讲仍不乐观。三阴乳腺癌的死亡风险比其他类型的乳腺癌要高很多。

发明内容

本发明的目的在于提供一种三阴乳腺癌预后预测装置、预测模型及其构建方法，从分子病理学角度和基因组学水平实现了三阴乳腺癌患者预后的风险分层，显著地将高低风险的患者分开，进而可以预测三阴乳腺癌的临床结果，指导个体化治疗，具有较高的临床应用价值。

为实现上述目的，本发明采取的技术方案为：

一种三阴乳腺癌预后预测模型构建方法，包括以下步骤：

S1、实现三阴乳腺癌样本原始基因表达数据和相应的临床生存数据的收集，并实现基因表达数据的标准化处理后，获得基因表达矩阵；

S2、获取三阴乳腺癌独立的成癌特异基因，并获取此类基因表达量；

S3、从获取的独立的成癌特异基因中筛选出构建预后预测模型的参数并获取对应的回归系数，所述参数为多个基因类型；

S4、基于筛选出的基因，根据其表达量和对应的回归系数，计算风险评分，得到三阴乳腺癌预后预测模型。

进一步地，所述步骤S1中， 基于UCSC-TCGA数据库实现三阴乳腺癌样本原始基因表达数据和相应的临床生存数据的收集，在收集过程中需去除临床数据不完整和总生存时间小于一个月的样本数据。

进一步地，所述步骤S3具体包括如下步骤：