[发明专利]一种基于花生基因组的InDel标记、引物组合和应用

权利要求书

1.一种检测InDel位点的试剂，其特征在于，所述试剂用于检测InDel位点1～100中的一个或几个，

InDel位点1位于花生基因组第1条染色体599074～599103bp处，缺失核苷酸序列如SEQID NO:1所示；

InDel位点2位于花生基因组第1条染色体7322798～7322810bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示；

InDel位点3位于花生基因组第1条染色体30160043～30160059bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示；

InDel位点4位于花生基因组第1条染色体58639924～58639943bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:4所示；

InDel位点5位于花生基因组第1条染色体93361071～93361111bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:5所示；

InDel位点6位于花生基因组第2条染色体9545101～9545143bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:6所示；

InDel位点7位于花生基因组第2条染色体62019854～62019876bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:7所示；

InDel位点8位于花生基因组第2条染色体84652765～84652786bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:8所示；

InDel位点9位于花生基因组第2条染色体90404960～90404991bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:9所示；

InDel位点10位于花生基因组第2条染色体98396654～98396663bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:10所示；

InDel位点11位于花生基因组第3条染色体635503～635534bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:11所示；

InDel位点12位于花生基因组第3条染色体7536314～7536345bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:12所示；

InDel位点13位于花生基因组第3条染色体14578594～14578627bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:13所示；

InDel位点14位于花生基因组第3条染色体24769432～24769466bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:14所示；

InDel位点15位于花生基因组第3条染色体38105221～38105252bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:15所示；

InDel位点16位于花生基因组第4条染色体1589343～1589390bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:16所示；

InDel位点17位于花生基因组第4条染色体11142539～11142550bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:17所示；

InDel位点18位于花生基因组第4条染色体19548938～19548984bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:18所示；

InDel位点19位于花生基因组第4条染色体46340491～46340517bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:19所示；

InDel位点20位于花生基因组第4条染色体79992651～79992669bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:20所示；

InDel位点21位于花生基因组第4条染色体117138640～117138704bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:21所示；

InDel位点22位于花生基因组第5条染色体6685615～6685628bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:22所示；

InDel位点23位于花生基因组第5条染色体10143817～10143839bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:23所示；

InDel位点24位于花生基因组第5条染色体18692862～18692898bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:24所示；

InDel位点25位于花生基因组第5条染色体41153241～41153253bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:25所示；

InDel标记26位于花生基因组第5条染色体101215984～101216012bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:26所示；

InDel位点27位于花生基因组第6条染色体213761～213803bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:27所示；

InDel位点28位于花生基因组第6条染色体7738896～7738938bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:28所示；

InDel位点29位于花生基因组第6条染色体16753094～16753135bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:29所示；

InDel位点30位于花生基因组第6条染色体35654432～35654450bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:30所示；

InDel位点31位于花生基因组第6条染色体78698302～78698315bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:31所示；

InDel位点32位于花生基因组第7条染色体3025357～3025367bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:32所示；

InDel位点33位于花生基因组第7条染色体14408066～14408085bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:33所示；

InDel位点34位于花生基因组第7条染色体37163220～37163230bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:34所示；

InDel位点35位于花生基因组第7条染色体65094718～65094743bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:35所示；

InDel位点36位于花生基因组第7条染色体80495745～80495753bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:36所示；

InDel位点37位于花生基因组第8条染色体6906380～6906425bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:37所示；

InDel位点38位于花生基因组第8条染色体34520855～34520870bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:38所示；

InDel位点39位于花生基因组第8条染色体36817509～36817521bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:39所示；

InDel位点40位于花生基因组第8条染色体44121877～44121892bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:40所示；

InDel位点41位于花生基因组第8条染色体51312888～51312911bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:41所示；

InDel位点42位于花生基因组第9条染色体900875～900936bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:42所示；

InDel位点43位于花生基因组第9条染色体4960082～4960095bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:43所示；

InDel位点44位于花生基因组第9条染色体10690185～10690210bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:44所示；

InDel位点45位于花生基因组第9条染色体45597466～45597500bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:45所示；

InDel位点46位于花生基因组第9条染色体120483318～120483327bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:46所示；

InDel位点47位于花生基因组第10条染色体721938～721975bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:47所示；

InDel位点48位于花生基因组第10条染色体4906086～4906097bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:48所示；

InDel位点49位于花生基因组第10条染色体15089116～15089147bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:49所示；

InDel位点50位于花生基因组第10条染色体100687174～100687189bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:50所示；

InDel位点51位于花生基因组第10条染色体116836413～116836426bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:51所示；

InDel位点52位于花生基因组第11条染色体283209～283218bp处，缺失核苷酸序列为SEQ ID NO:52所示的片段；

InDel位点53位于花生基因组第11条染色体13257880～13257926bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:53所示；

InDel位点54位于花生基因组第11条染色体40843250～40843299bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:54所示；

InDel位点55位于花生基因组第11条染色体133477886～133477902bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:55所示；

InDel位点56位于花生基因组第11条染色体148909217～148909247bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:56所示；

InDel位点57位于花生基因组第12条染色体1220578～1220588bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:57所示；

InDel位点58位于花生基因组第12条染色体7749235～7749247bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:58所示；

InDel位点59位于花生基因组第12条染色体93622076～93622088bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:59所示；

InDel位点60位于花生基因组第12条染色体105273193～105273212bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:60所示；

InDel位点61位于花生基因组第12条染色体116578269～116578281bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:61所示；

InDel位点62位于花生基因组第13条染色体29567254～29567263bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:62所示；

InDel位点63位于花生基因组第13条染色体92058283～92058308bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:63所示；

InDel位点64位于花生基因组第13条染色体126582184～126582199bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:64所示；

InDel位点65位于花生基因组第13条染色体145260333～145260358bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:65所示；

InDel位点66位于花生基因组第14条染色体749582～749601bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:66所示；

InDel位点67位于花生基因组第14条染色体9346648～9346657bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:67所示；

InDel位点68位于花生基因组第14条染色体101025687～101025698bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:68所示；

InDel位点69位于花生基因组第14条染色体113335926～113335965bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:69所示；

InDel位点70位于花生基因组第14条染色体140139380～140139426bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:70所示；

InDel位点71位于花生基因组第15条染色体7469475～7469493bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:71所示；

InDel位点72位于花生基因组第15条染色体26539988～26540001bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:72所示；

InDel位点73位于花生基因组第15条染色体121908908～121908918bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:73所示；

InDel位点74位于花生基因组第15条染色体139761848～139761869bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:74所示；

InDel位点75位于花生基因组第15条染色体159743019～159743054bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:75所示；

InDel位点76位于花生基因组第16条染色体656032～656041bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:76所示；

InDel位点77位于花生基因组第16条染色体10539748～10539757bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:77所示；

InDel位点78位于花生基因组第16条染色体26102229～26102240bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:78所示；

InDel位点79位于花生基因组第16条染色体148647104～148647124bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:79所示；

InDel位点80位于花生基因组第17条染色体1048493～1048511bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:80所示；

InDel位点81位于花生基因组第17条染色体12616089～12616102bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:81所示；

InDel位点82位于花生基因组第17条染色体22754495～22754513bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:82所示；

InDel位点83位于花生基因组第17条染色体133969103～133969121bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:83所示；

InDel位点84位于花生基因组第18条染色体1447215～1447237bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:84所示；

InDel位点85位于花生基因组第18条染色体10673810～10673835bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:85所示；

InDel位点86位于花生基因组第18条染色体38060957～38060998bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:86所示；

InDel位点87位于花生基因组第18条染色体117764644～117764665bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:87所示；

InDel位点88位于花生基因组第18条染色体134875101～134875113bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:88所示；

InDel位点89位于花生基因组第19条染色体91738～91757bp处，缺失核苷酸序列如SEQID NO:89所示；

InDel位点90位于花生基因组第19条染色体10430056～10430069bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:90所示；

InDel位点91位于花生基因组第19条染色体105532278～105532311bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:91所示；

InDel位点92位于花生基因组第19条染色体153518580～153518596bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:92所示；

InDel位点93位于花生基因组第19条染色体159077765～159077781bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:93所示；

InDel位点94位于花生基因组第20条染色体1619728～1619758bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:94所示；

InDel位点95位于花生基因组第20条染色体17589342～17589356bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:95所示；

InDel位点96位于花生基因组第20条染色体17868923～17868974bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:96所示；

InDel位点97位于花生基因组第20条染色体36913922～36913948bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:97所示；

InDel位点98位于花生基因组第20条染色体37613378～37613393bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:98所示；

InDel位点99位于花生基因组第20条染色体143953254～143953264bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:99所示；

InDel位点100位于花生基因组第20条染色体144577785～144577796bp处，缺失核苷酸序列如SEQ ID NO:100所示；

所述花生基因组为PeanutBase数据库Tifrunner基因组1.0版本。