[发明专利]一种基因组学数据管理与诊疗系统及方法在审

专利信息
申请号: 202110974677.5 申请日: 2021-08-24
公开(公告)号: CN113782130A 公开(公告)日: 2021-12-10
发明(设计)人: 曹小伍;曹景溢;华国明 申请(专利权)人: 杭州翔毅科技有限公司
主分类号: G16H10/60 分类号: G16H10/60;G16H20/10;G16H50/20;G16H50/70;G16B20/00;G16B50/00
代理公司: 杭州杭诚专利事务所有限公司 33109 代理人: 刘正君
地址: 311200 浙江省杭州市萧山区*** 国省代码: 浙江;33
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摘要:
搜索关键词: 一种 基因组 数据管理 诊疗 系统 方法
【权利要求书】:

1.一种基因组学数据管理与诊疗系统,其特征在于,包括:

信息输入模块(1):用于输入患者的癌症基因组学数据;

数据库模块(2):保存各种癌症的常见亚型的基因组学数据;

数据管理模块(3):根据输入的患者信息调取相应的基因组学数据以及药物组合预测结果;

用药辅助推荐系统(4):根据调取的数据与患者数据对比,对患者进行精准化用药辅助;

所述用药辅助推荐系统(4)包括:

基因组合预测单元(5):对癌症驱动基因和药物组合的个体化进行预测;

药物与基因试验单元(6):对靶向药及小分子药的抗癌新适应症进行预测,以及已知药物的重定位和组合用药筛选。

2.根据权利要求1所述的一种基因组学数据管理与诊疗系统,其特征在于,所述的信息输入模块(1)包括:

显示模块(7):用于输入患者身份信息,显示数据库信息;

数据传输模块(8):根据患者输入的身份信息,从医疗系统中调取患者癌症基因组学数据。

3.根据权利要求1所述的一种基因组学数据管理与诊疗系统,其特征在于,所述的数据管理模块(3)包括:

数据更新单元(9):实时更新数据库模块内的基因组学数据;

数据调用单元(10):根据信息输入模块的内容调取数据库模块中相应亚型的基因组学数据。

4.根据权利要求1所述的一种基因组学数据管理与诊疗系统,其特征在于,所述的基因组合预测单元(5)包括建模模块,所述建模模块用于将癌症驱动基因以及药物组合作为输入,将对应的治疗效果作为输出,训练得到癌症诊疗预测模型。

5.一种基因组学数据管理与诊疗方法,采用权利要求1-4任意一项权利要求所述的系统,其特征在于,包括以下步骤:

S1:采集各种癌症的癌症基因组学数据,建立癌症基因组学数据库;

S2:根据数据库里面的数据构建全基因组的样本空间;

S3:基于基因组学数据,利用人工智能和生物信息学算法,构建面向患者的个体化精准用药辅助推荐系统(4);

S4:建立用于基因组学数据的检索,查询及权限管理控制的数据管理模块(3);

S5:将患者的信息输入至用药辅助推荐系统(4),用药辅助系统根据患者的基因情况进行组合用药筛选。

6.根据权利要求5所述的一种基因组学数据管理与诊疗方法,其特征在于,所述的步骤S1进一步表示为:面向某种癌症,向各大医疗机构搜集该种癌症患者的基因组学,建立覆盖该种癌症常见亚型的癌症基因组学数据组;多种癌症基因组学数据组保存在一起,构建出癌症基因组学数据库。

7.根据权利要求5或6所述的一种基因组学数据管理与诊疗方法,其特征在于,所述的步骤S2中的样本空间包括各种癌症的患者的全基因组的样本空间,以及正常细胞的全基因组的样本空间,将正常细胞的样本空间作为对照组。

8.根据权利要求5所述的一种基因组学数据管理与诊疗方法,其特征在于,所述的步骤S3中,利用人工智能和生物信息学算法,构建面向患者的个体化精准用药辅助推荐系统(4)的具体步骤为:

S3.1:利用遗传学分类算法,通过基因网络分析,对癌症的不同亚型进行分类;

S3.2:根据区分的癌症类型和其控制的组织进行药物靶点的预测;

S3.3:利用随机森林算法构建癌症诊疗预测模型。

9.根据权利要求5-8任意一项所述的一种基因组学数据管理与诊疗方法,其特征在于,所述的步骤S5进一步表示为:将患者的癌症基因组学信息输入至用药辅助推荐系统(4),然后选择癌症类别以及亚型,数据管理模块(3)对数据库进行更新,用药辅助推荐系统(4)根据该亚型的常见用药方式进行个体化诊断,对个体进行靶向药及小分子药的抗癌新适应症进行预测以及已知药物的重定位和组合用药筛选。

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