[发明专利]一种氨磷汀抗辐射损伤相关基因筛选与功能分析方法在审
| 申请号： | 202110984988.X | 申请日： | 2021-08-25 |
| 公开（公告）号： | CN113774125A | 公开（公告）日： | 2021-12-10 |
| 发明（设计）人： | 王远飞;李曙芳;李建国;秦秀军;孙鸽;刘欢;刘梦雅;王若琪;张亚娟;王志鹏;李建华 | 申请（专利权）人： | 中国辐射防护研究院 |
| 主分类号： | C12Q1/6883 | 分类号： | C12Q1/6883;C12Q1/6869 |
| 代理公司： | 北京天悦专利代理事务所(普通合伙) 11311 | 代理人： | 田明;周敏毅 |
| 地址： | 030006 山*** | 国省代码： | 山西;14 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 一种 氨磷汀抗 辐射损伤 相关 基因 筛选 功能分析 方法 | ||
1.一种氨磷汀抗辐射损伤相关基因筛选与功能分析方法，其特征在于，所述的方法包括如下步骤：
(1)注射与辐照：对多只大鼠分别腹腔注射氨磷汀后，对部分大鼠分别进行辐照；
(2)RNA提取：分别摘取每只未辐照的大鼠与每只辐照后的大鼠的脏器并分别进行组织RNA提取；
(3)建立测序用cDNA文库：由步骤(2)提取的RNA分别建立每只未辐照的大鼠与每只辐照后的大鼠的测序用cDNA文库；
(4)高通量测序：对步骤(3)建立的每只未辐照的大鼠与每只辐照后的大鼠的测序用cDNA文库分别进行高通量测序；
(5)测序结果分析：根据步骤(4)的高通量测序结果，计算每只未辐照的大鼠与每只辐照后的大鼠的不同基因的表达量，筛选出未辐照的大鼠与辐照后的大鼠的差异表达基因，并寻找差异表达基因的富集通路，分析差异表达基因的功能。
2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于：所述的大鼠为SD大鼠。
3.根据权利要求1所述的方法，其特征在于：步骤(1)中，每只大鼠的氨磷汀注射剂量为100-200mg/kg。
4.根据权利要求1所述的方法，其特征在于：步骤(1)中，每只大鼠在注射氨磷汀后20-60分钟进行辐照，辐照剂量为10-30Gy。
5.根据权利要求1所述的方法，其特征在于：步骤(2)中，所述的脏器为大鼠胸部肺脏。
6.根据权利要求1所述的方法，其特征在于：步骤(3)中，对步骤(2)提取的RNA富集mRNA，将RNA片段化，反转录合成cDNA并进行末端修复，连接产物通过特异的引物进行桥式PCR扩增，从而建立测序用cDNA文库。
7.根据权利要求1所述的方法，其特征在于：步骤(4)中，用BGISEQ-500平台进行所述的高通量测序。
8.根据权利要求1所述的方法，其特征在于：步骤(5)中，寻找差异表达基因的富集通路通过KEGG通路富集分析实现。
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