[发明专利]一种甲基丙二酸血症相关基因MMACHC突变位点及其检测方法

说明书

本发明关于生物技术领域，涉及甲基丙二酸血症相关基因的突变位点及其检测方法，本发明所述的甲基丙二酸血症的相关基因为MMACHC和MMUT，其中甲基丙二酸血症相关基因MMACHC有13种基因位点突变与甲基丙二酸血症相关，所述突变位点为：c.2 TG、c.2 TC、c.81+1 GA、c.395 GA、c.426 CA、c.427 CT、c.429+1 GC、c.481 CG、c.481 CA、c.616del、c.616 CT、c.617GC或c.626_627delTG。本发明通过二代靶向测序检测是否存在这些突变位点，其可以作为预测待测样本是否患有甲基丙二酸血症的筛查方法，为日后研究治疗甲基丙二酸血症的药物提供新的治疗途径。

技术领域

本发明关于生物技术领域，涉及一种甲基丙二酸血症相关基因MMACHC突变位点及其检测方法。

背景技术

甲基丙二酸血症(MethylmalonicAciduria,MMA)属常染色体隐性遗传遗传病，是致命的，严重的异质性丙二酸甲酯和钴胺素代谢异常，预后不良所致。MMA患者的发病率和死亡率很高，长期生存的预后很差。其发作期从新生儿期到成年期不等，患病的儿童通常表现出厌食症，肌张力低下，发育迟缓，进行性肾衰竭，功能性免疫功能减退，视神经萎缩和血液学异常。严重者可引起酮症酸中毒、低血糖、高血氨、高甘氨酸血症，在新生儿、婴幼儿期病死率较高。造成这样后果的一个重要原因是MMA的致病突变还未完全清楚，导致患者在未发病时通过基因筛查不能尽早的发现患病风险，因此不能尽早进行干预。

目前临床上主要检测方法为临床症状结合尿气相色谱质谱检测、血串联质谱检测，需要反复检测或基因检测才能诊断或排除此病。对于检测胎儿是否患病是通过妊娠过程中羊水穿刺进行甲基丙二酸血症(MMA)的产前筛查，它是一项侵入性的操作技术，对于操作人员，环境，孕周等有严格的要求限制。而由于基因检测中现有致病位点的不全面，即现有致病位点大多为发病率较高的致病位点，某些发病率较低或其它导致MMA的突变位点目前不明确，因此会导致假阴性结果。

目前在临床诊断中检测基因致病位点的方法主要为一代测序，即Sanger测序，此种方法成本高通量低，所需时间较长，检测效率低下。

发明内容

本发明的目的在于克服现有MMA基因突变位点的不完整，提供新的13种MMACHC基因突变，使MMA的基因检测更加准确，检测出MMA的相关的基因突变后，尽早进行干预和治疗。

为实现上述发明目的，本发明采用以下技术方案：

一种甲基丙二酸血症相关基因MMACHC突变位点，所述突变位点为：c.2TG、c.2TC、c.81+1GA、c.395GA、c.426CA、c.427CT、c.429+1GC、c.481CG、c.481CA、c.616del、c.616CT、c.617GC或c.626_627delTG；

上述突变点的起始位置和基因序列为：

一种上述甲基丙二酸血症相关基因突变位点的检测方法，采用二代靶向测序检测。所述的二代靶向测序检测采用二代靶向测序Ion S5^TM测序仪

有益效果

(1)本发明通过二代靶基因测序技术检测遗传物质是否为突变基因携带者，来评估患甲基丙二酸血症的风险，通过提取出患病新生儿血液中的DNA，利用二代靶基因测序技术检测患者的DNA序列，与健康人的基因进行比对，得出新的13种MMACHC基因位点突变与甲基丙二酸血症相关与甲基丙二酸血症相关。本发明扩大MMA了产前筛查的范围，能够在婚前、产前评估MMA患病风险，在最大程度上防止MMA胎儿的出生，具有非常重要的临床意义和社会意义。