[发明专利]小麦每穗小穗数及抗旱性状相关SNP位点及其应用有效
申请号: | 202111026460.8 | 申请日: | 2021-09-02 |
公开(公告)号: | CN113621733B | 公开(公告)日: | 2023-07-18 |
发明(设计)人: | 郭琳;张琦;刘西岗;李永鹏;景瑞莲 | 申请(专利权)人: | 河北师范大学 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11;A01H1/04 |
代理公司: | 石家庄轻拓知识产权代理事务所(普通合伙) 13128 | 代理人: | 张培元 |
地址: | 050021 河*** | 国省代码: | 河北;13 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 小麦 小穗 抗旱 性状 相关 snp 及其 应用 | ||
1.一种鉴定小麦每穗小穗数及抗旱性状的方法,其特征在于:该方法包括如下步骤:
A、对待测小麦基因组DNA中任意一段包含如下SNP位点的DNA片段进行PCR扩增,并将该PCR扩增产物进行酶切鉴定;所述SNP位点对应于SEQ ID NO.1所示序列自5’末端第2038位碱基;
B、确定待测小麦的基因型,所述SNP位点处的核苷酸为A/A纯合时,相对应的基因型是甲;所述SNP位点处的核苷酸为G/G纯合时,相对应的基因型是乙;
C、根据待测小麦基因型按照如下标准确定待测小麦的每穗小穗数及抗旱性状:C-1,每穗小穗数性状为:基因型甲纯合的小麦大于基因型乙纯合的小麦;C-2,抗旱性性状为:基因型甲纯合的小麦弱于基因型乙纯合的小麦。
2.根据权利要求1所述的鉴定小麦每穗小穗数及抗旱性状的方法,其特征在于:步骤A中:
所述的PCR扩增的DNA片段为SEQ ID NO.1中5’末端1947-2065bp;所述的PCR扩增的特异性引物对为SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.3组成的引物对1F和1R,SEQ ID NO.4和SEQ IDNO.5组成的引物对2F和2R;
所述的酶切包括以下步骤:以小麦基因组DNA为模板,以引物1F和1R为引物对扩增得到PCR产物;将此PCR产物稀释100倍,以其作为模板,以引物2F和2R为引物对扩增得到PCR产物;用限制性内切酶ApaI酶切PCR产物;
步骤B中:若PCR产物不能被切开,则该核苷酸多态性位点为G/G,基因型为乙;若PCR产物可以被切开,则该核苷酸多态性位点为A/A,基因型为甲。
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