[发明专利]一种对MDA单细胞全基因组扩增产物的质控方法在审

专利信息
申请号: 202111041800.4 申请日: 2021-09-07
公开(公告)号: CN113584138A 公开(公告)日: 2021-11-02
发明(设计)人: 黄朋;蓝云月;何升;罗静思;林陆叶;张晓菲;梁丽芳 申请(专利权)人: 广西壮族自治区妇幼保健院
主分类号: C12Q1/686 分类号: C12Q1/686
代理公司: 广西中知科创知识产权代理有限公司 45130 代理人: 汤凌志
地址: 530000 广西壮*** 国省代码: 广西;45
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摘要:
搜索关键词: 一种 mda 单细胞 基因组 扩增 产物 方法
【权利要求书】:

1.一种对MDA单细胞全基因组扩增产物的质控方法,其特征在于:包含8对引物,分别扩增8个管家基因的相应DNA片段,包括如下步骤:

1)所用的8对引物序列合成后,采用PAG法纯化并冻干成粉末状保存、运输;

2)将8对引物分别用ddH2O稀释成100μmol/L的母液,再各取20μl上下游引物母液混合在一起并调整浓度至10μmol/L,制备成引物工作液;

3)吸取2μl WGA产物和2μl引物工作液,采用HiFi酶或者其它高效、高保真聚合酶进行PCR反应;

4)PCR反应结束后,取10μl产物并加入2μl 6×DNA loading buffer混匀后,在2%琼脂糖凝胶上电泳,120V,35min,然后在凝胶成像仪上紫外光成像;如果模板DNA质量较好,理论上可以扩增出8条产物;如果只有6个及以上扩增产物,则说明该模板DNA可用于下游基因芯片检测,且条带越多、越清晰明亮,表明模板DNA的质量越好,基因芯片的检测结果越理想;

所用的8对引物序列和扩增产物的片段长度如下所示:

2.根据权利要求1所述的一种对MDA单细胞全基因组扩增产物的质控方法,其特征在于:步骤3)所述的高效聚合酶,选自HiFi高保真酶。

3.根据权利要求1所述的一种对MDA单细胞全基因组扩增产物的质控方法,其特征在于:步骤3)所述的进行PCR反应,反应体系和热循环条件如下:

10×HiFi Buffer I 2.5μl+dNTP 2μl+2μl混合引物+0.5μl HiFi Polymerase+DNA溶液或WGA产物3μl+ddH2O 15μl,混均,总反应体积为25μl;94℃变性3min,94℃ 30s→61℃40s→72℃ 1min,循环35次,72℃延伸3min。

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