[发明专利]一种对MDA单细胞全基因组扩增产物的质控方法在审
申请号: | 202111041800.4 | 申请日: | 2021-09-07 |
公开(公告)号: | CN113584138A | 公开(公告)日: | 2021-11-02 |
发明(设计)人: | 黄朋;蓝云月;何升;罗静思;林陆叶;张晓菲;梁丽芳 | 申请(专利权)人: | 广西壮族自治区妇幼保健院 |
主分类号: | C12Q1/686 | 分类号: | C12Q1/686 |
代理公司: | 广西中知科创知识产权代理有限公司 45130 | 代理人: | 汤凌志 |
地址: | 530000 广西壮*** | 国省代码: | 广西;45 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 mda 单细胞 基因组 扩增 产物 方法 | ||
1.一种对MDA单细胞全基因组扩增产物的质控方法,其特征在于:包含8对引物,分别扩增8个管家基因的相应DNA片段,包括如下步骤:
1)所用的8对引物序列合成后,采用PAG法纯化并冻干成粉末状保存、运输;
2)将8对引物分别用ddH2O稀释成100μmol/L的母液,再各取20μl上下游引物母液混合在一起并调整浓度至10μmol/L,制备成引物工作液;
3)吸取2μl WGA产物和2μl引物工作液,采用HiFi酶或者其它高效、高保真聚合酶进行PCR反应;
4)PCR反应结束后,取10μl产物并加入2μl 6×DNA loading buffer混匀后,在2%琼脂糖凝胶上电泳,120V,35min,然后在凝胶成像仪上紫外光成像;如果模板DNA质量较好,理论上可以扩增出8条产物;如果只有6个及以上扩增产物,则说明该模板DNA可用于下游基因芯片检测,且条带越多、越清晰明亮,表明模板DNA的质量越好,基因芯片的检测结果越理想;
所用的8对引物序列和扩增产物的片段长度如下所示:
2.根据权利要求1所述的一种对MDA单细胞全基因组扩增产物的质控方法,其特征在于:步骤3)所述的高效聚合酶,选自HiFi高保真酶。
3.根据权利要求1所述的一种对MDA单细胞全基因组扩增产物的质控方法,其特征在于:步骤3)所述的进行PCR反应,反应体系和热循环条件如下:
10×HiFi Buffer I 2.5μl+dNTP 2μl+2μl混合引物+0.5μl HiFi Polymerase+DNA溶液或WGA产物3μl+ddH2O 15μl,混均,总反应体积为25μl;94℃变性3min,94℃ 30s→61℃40s→72℃ 1min,循环35次,72℃延伸3min。
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