[发明专利]菌种鉴定支援方法、多菌落学习模型的生成方法、菌种鉴定支援装置和程序产品

说明书

本发明提供一种菌种鉴定支援方法、多菌落学习模型的生成方法、菌种鉴定支援装置和程序产品。所述方法包括：取得包含多菌落的培养基的图像，所述多菌落由所培养的多个种类的细菌形成的多个菌落聚集而成，通过将所取得的图像输入多菌落学习模型，确定多菌落所含的多个菌种，所述多菌落学习模型在被输入包含多菌落的图像的情况下，进行图像识别，输出表示形成该多菌落的细菌的种类的信息。

技术领域

本发明涉及菌种鉴定支援方法、多菌落学习模型的生成方法、单菌落学习模型的生成方法、菌种鉴定支援装置和程序产品。

背景技术

传染病是由于细菌等侵入身体而引起的。通过对所感染的细菌进行鉴定，能够确定传染病，采取治疗或防止传染病传播等措施。在医院等医疗设施，对患者进行检查，在怀疑是传染病的情况下，从患者处采集标本，委托检查机构进行检查。检查机构进行检查，以对标本中所含的细菌进行鉴定。针对细菌鉴定检查，开发出了许多鉴定试剂盒，但能用于鉴定试剂盒的标本只有纯分离株。因此，在细菌鉴定检查中，需要首先对细菌进行分离培养。在分离培养之后，能够大致推定出使用哪个鉴定试剂盒是合适的。具体来说，通过检查技师观察分离株培养时的生长性和培养条件、菌落的性质状态(颜色、气味、溶血性、自溶、对培养基的渗透、迁移、滑行、等等)、革兰氏染色结果等来进行检查，能够大致推定菌种。细菌鉴定检查要求准确性、简便性、迅速性和经济效率，因此，根据这样的分离株菌种推定结果，推定适合该菌株判定的鉴定试剂盒，只有在该推定正确的情况下，才能正确鉴定细菌。但在推定不正确的情况下就不能鉴定细菌，需要再次进行推定。菌种的推定依照推定次数被称为一次辨认(一次影像解读)、二次辨认(二次影像解读)等。这样的检查顺序属于一般的细菌鉴定法。另一方面，近年来，已能够通过鉴定基因组核酸序列的测序仪或质量分析装置来鉴定细菌，但准确的菌种鉴定需要分离培养这一点并没有变。另外，细菌通过一个细胞分裂成两个进行增殖，一个细胞用肉眼无法看见，但是，例如增殖到一千万个以上的话，就会在平板培养基(琼脂培养基)上形成群落(菌落)，可用肉眼确认。而且，一个菌落源自一个细胞，因此，通过数菌落数就能确定培养前标本中的菌量(菌数)。

日本特开2012-135240号公报公开了一种菌落识别系统，包括可见光照射图像取得部、非可见光照射图像取得部和菌落识别部，可见光照射图像取得部取得可见光照射图像，也就是在对形成于培养基的细菌的菌落照射可见光的状态下拍摄菌落得到的图像，非可见光照射图像取得部取得非可见光照射图像，也就是在对菌落照射非可见光的状态下拍摄菌落所得的图像，菌落识别部根据可见光照射图像和非可见光照射图像识别形成了菌落的细菌。

日本特开2020-18249号公报公开了一种细菌菌落的鉴定装置，包括照明装置、透过照明手段、拍摄手段、数据库和信号处理部，照明装置对收纳于光学透明容器的培养基上培养的细菌菌落进行照明，透过照明手段使照明光透过光学透明容器和培养基对该细菌菌落进行照明，拍摄手段对用各照明手段照明的细菌菌落进行拍摄，数据库中存储有多个细菌种类的多个培养时间内的细菌菌落的图像和光谱数据，信号处理部将由拍摄手段拍摄的该细菌菌落的拍摄图像与数据库中保存的信息进行比较，识别该细菌菌落的种类。

发明内容

本发明的目的在于，提供能够确定多菌落所含的多个菌种的菌种鉴定支援方法、多菌落学习模型的生成方法、单菌落学习模型的生成方法、菌种鉴定支援装置和程序产品。

本发明的菌种鉴定支援方法，取得包含多菌落的培养基的图像，所述多菌落由所培养的多个种类的细菌形成的多个菌落聚集而成，通过将所取得的图像输入多菌落学习模型，确定多菌落所含的多个菌种，所述多菌落学习模型在被输入包含多菌落的图像的情况下，进行图像识别，输出表示形成该多菌落的细菌的种类的信息。