[发明专利]一种早产预测标志物的羊水蛋白质组学检测方法及应用在审
申请号: | 202111046766.X | 申请日: | 2021-09-06 |
公开(公告)号: | CN113933407A | 公开(公告)日: | 2022-01-14 |
发明(设计)人: | 王谢桐;李安娜;张美华;房振亚 | 申请(专利权)人: | 山东省妇幼保健院 |
主分类号: | G01N30/02 | 分类号: | G01N30/02;G01N30/06;G01N30/34;G01N30/72;G01N30/86;G01N33/68;C12P21/06 |
代理公司: | 北京云嘉湃富知识产权代理有限公司 11678 | 代理人: | 阮文 |
地址: | 250014 山东*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 早产 预测 标志 羊水 蛋白质 检测 方法 应用 | ||
1.一种早产预测标志物的羊水蛋白质组学检测方法,其特征在于,所述早产预测标志物的羊水蛋白质组学检测方法包括:
步骤一,通过液相色谱-质谱联用的方法获得羊水差异表达蛋白;
步骤二,差异蛋白的GO功能表征及KEGG通路分析;
步骤三,应用酶联免疫吸附试验对选定的候选蛋白进行验证。
2.根据权利要求1所述的早产预测标志物的羊水蛋白质组学检测方法,其特征在于,所述步骤一具体包括:
对足月产正常对照组、足月组、早产组羊水通过液相色谱-质谱联用的方法进行蛋白组检测,确定四个重叠的部门集群内的羊水差异表达蛋白质DEPs。
3.根据权利要求1所述的早产预测标志物的羊水蛋白质组学检测方法,其特征在于,所述步骤二具体包括:
通过GO数据库从生物过程、细胞成分和分子功能对DEPs进行分类;
通过KEGG分析DEPs的生物学功能,包含9种信号通路,包括碳代谢、糖酵解/糖异生、氨基酸生物合成、补体和凝血级联、HIF-1信号通路、蛋白质消化和吸收、白细胞跨内皮迁移、肾素-血管紧张素系统、谷胱甘肽代谢;
分析与不明原因早产相关的DEPs的蛋白质相互作用网络,并基于44种蛋白质构建蛋白质-蛋白质相互作用网络,根据统计显著性、生物学机制及与不明原因早产相关的差异表达选择目标蛋白质。
4.根据权利要求1所述的早产预测标志物的羊水蛋白质组学检测方法,其特征在于,所述步骤三第二个独立队列的样品包括:20名34周前分娩的病例组羊水样本和20名足月分娩对照组羊水样本。
5.根据权利要求1所述的早产预测标志物的羊水蛋白质组学检测方法,其特征在于,所述早产预测标志物的羊水蛋白质组学检测方法具体包括:
步骤1,实验分组:足月产正常对照组、出现早产征兆经过宫颈环扎保胎到≥37周的足月组、出现早产征兆经过宫颈环扎<34周分娩的早产组;
步骤2,羊水标本收集和处理;
步骤3,蛋白组学分析;
步骤4,筛选早产潜在预测标志物;
步骤5,利用筛选早产潜在预测标志物进行对照组、早产组识别;
步骤6,对选定的候选蛋白进行验证。
6.根据权利要求5所述的早产预测标志物的羊水蛋白质组学检测方法,其特征在于,所述步骤3蛋白组学分析包括:
样品预处理,羊水样品在4℃下以12000g离心10分钟,以去除杂质;
蛋白组学检测:进行胰酶酶解、TMT或iTRAQ标记、HPLC分级、液相色谱-质谱联用分析、数据库搜索、生物信息学分析以及蛋白功能富集分析。
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