[发明专利]用于检测松材线虫的crRNA及试剂盒有效
申请号: | 202111077374.X | 申请日: | 2021-09-15 |
公开(公告)号: | CN113512596B | 公开(公告)日: | 2021-12-24 |
发明(设计)人: | 王永林;唐晨;武瑾;尹康权;李学武;宗世祥 | 申请(专利权)人: | 北京林业大学 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/6844;C12N15/113 |
代理公司: | 北京华进京联知识产权代理有限公司 11606 | 代理人: | 信建 |
地址: | 100089 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 检测 松材线虫 crrna 试剂盒 | ||
1.用于检测松材线虫的crRNA,其特征在于,包含a)向导序列为SEQ ID NO:1~2中的一种,其能够杂交至靶RNA序列,和b) 与Cas核酸酶相互作用的框架核酸片段。
2.根据权利要求1所述的crRNA,其特征在于,所述向导序列为SEQ ID NO:2。
3.用于检测松材线虫的试剂盒,其特征在于,包含权利要求1~2任一项所述的crRNA或可转录为所述crRNA的DNA;
还包含Cas核酸酶、信号报告分子、阳性对照和用于CRISPR检测体系的缓冲液中的至少一种。
4.根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,所述可转录为所述crRNA的DNA选自SEQID NO:10~11中的一种。
5.根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,Cas核酸酶选自Cas13;
所述与Cas核酸酶相互作用的框架核酸片段如SEQ ID NO:4所示。
6.根据权利要求3~5任一项所述的试剂盒,其特征在于,所述信号报告分子为信号报告RNA分子,所述信号报告RNA分子为具有信号报告功能的RNA分子,当其中的RNA序列被降解时,可报告阳性信号并被检测到。
7.根据权利要求6所述的试剂盒,其特征在于,包括试纸条,所述试纸条用以与所述信号报告RNA分子作用并显示所述信号报告RNA分子的信号结果。
8.根据权利要求7所述的试剂盒,其特征在于,所述信号报告RNA分子的两端分别标记有第一标记物和第二标记物,如此,当所述信号报告RNA分子被CRISPR检测体系切割时,所述第一标记物与所述第二标记物分离;
所述试纸条包括样品垫、反应膜和吸收垫,所述反应膜上设置有检测区和质检区;
其中:
所述检测区固定包被信号物质,所述信号物质上标记有针对所述第一标记物的第一抗标记物;
所述质检区固定包被有针对所述第二标记物的抗体;
所述第一标记物与所述第一抗标记物能够形成标记物-抗标记物复合物,且所述第一抗标记物与所述第二标记物的抗体不同。
9.根据权利要求8所述的试剂盒,其特征在于,所述信号物质选自荧光团、比色标记、量子点、胶体金、生物素、用于拉曼衍射成像的炔烃基团、用于click反应的环烯烃、用于聚合物标记的引发基团、多肽/蛋白分子、LNA/PNA、非天然氨基酸及其类似物、非天然核酸及其类似物和纳米结构中的至少一种;
所述纳米结构包括无机纳米颗粒、NV-center、聚集/组装诱导发光分子、稀土离子配体分子以及多金属氧簇。
10.根据权利要求8所述的试剂盒,其特征在于,还包含RNA聚合酶、扩增引物、DNA聚合酶、扩增缓冲液、样品预处理试剂和水中的至少一种;
其中所述扩增引物用于扩增含有所述crRNA靶向序列的核酸片段。
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