[发明专利]基于单一标准FRET质粒测量FRET系统矫正参数的方法及其应用有效

专利信息
申请号: 202111083669.8 申请日: 2021-09-14
公开(公告)号: CN113899722B 公开(公告)日: 2022-11-01
发明(设计)人: 陈同生;刘智 申请(专利权)人: 华南师范大学
主分类号: G01N21/64 分类号: G01N21/64
代理公司: 广州市华学知识产权代理有限公司 44245 代理人: 刘瑜
地址: 510631 广东省广州*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 基于 单一 标准 fret 质粒 测量 系统 矫正 参数 方法 及其 应用
【权利要求书】:

1.一种基于单一标准FRET质粒测量FRET系统矫正参数的方法,其特征在于,包括如下步骤:

(1)圈选细胞区域获取三通道平均荧光强度数据

将已知效率值E1与供体受体浓度比R1的标准FRET质粒转染到细胞中,待转染的质粒表达成功后,先选定n个细胞分别进行三通道荧光成像,获得三通道平均荧光强度IDD、IAA、IDA图像,然后在IDD、IAA、IDA图像中的细胞里圈选m个不同细胞区域,分别获得三通道平均荧光强度IDD1、IAA1、IDA1,IDD2、IAA2、IDA2......IDDm、IAAm、IDAm,并以第1个细胞区域获得的三通道平均荧光强度IDD1、IAA1、IDA1为第一小组数据,以第2个细胞区域获得的三通道平均荧光强度IDD2、IAA2、IDA2为第二小组数据,依次类推,以第m个细胞区域获得的三通道平均荧光强度IDDm、IAAm、IDAm为第m小组数据,再以2个细胞区域的数据为一组,将数据两两分为t组;其中,n为正整数且n≥1,m≥2,t≥1;

(2)计算FRET系统矫正参数β,λ,G因子和k因子

①根据步骤(1)中得到的t组数据中的第一组数据和如下方程计算FRET系统矫正参数β1,λ1,G1和k1

min f(β1,λ1,G1,k1)=|y1|+|y2|+|y3|+|y4|

s.t.

β1>0;λ1>0;G1>0;k1>0;

λ′+e>λ1>λ′-e;

β′+e1>β1>β′-e1

0<e1<1;0<e<1;

e为大于零的常数,e1为大于零的常数;

其中:

λ′为供体发射光谱和受体发射滤光片光谱通带交点处最高效率值e与供体发射光谱和供体发射滤光片光谱通带交点处最高效率值eDd的比值λ′=eDa/eDd

β′为受体激发光谱和供体激发滤光片光谱通带交点处最高效率值edA与受体激发光谱和受体激发滤光片光谱通带交点处最高效率值eaA的比值乘以供体激发和受体激发的照明相对强度比φ的结果值β′=(edA/eaA)*φ;

②将步骤①中的第一组数据替换为第二组数据,按上述方程计算得到FRET系统矫正参数β2,λ2,G2和k2;依次类推,直到计算得到第t组数据的FRET系统矫正参数βt,λt,Gt和kt;最后分别求β1、β2......βt,λ1、λ2......λt,G1、G2......Gt和k1、k2......kt的平均值βv,λv,Gv,kv;该βv,λv,Gv,kv即为FRET系统矫正参数β,λ,G因子和k因子。

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