[发明专利]一种基于RT-PCR技术检测RB-N1基因型柑橘衰退病毒用试剂盒及其检测方法有效
申请号: | 202111085900.7 | 申请日: | 2021-09-16 |
公开(公告)号: | CN113637804B | 公开(公告)日: | 2023-10-20 |
发明(设计)人: | 易龙;李双花;周俊;黄爱军;苏华楠 | 申请(专利权)人: | 赣南师范大学 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/686;C12N15/11 |
代理公司: | 北京高沃律师事务所 11569 | 代理人: | 薛红凡 |
地址: | 341000 江西省赣*** | 国省代码: | 江西;36 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 rt pcr 技术 检测 rb n1 基因型 柑橘 衰退 病毒 试剂盒 及其 方法 | ||
1.一种检测RB-N1基因型柑橘衰退病毒的引物对,其特征在于,包括RB-N1F和RB-N1R2;
所述RB-N1F的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示;
所述RB-N1R2的核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示。
2.一种基于RT-PCR技术检测RB-N1基因型柑橘衰退病毒用试剂盒,其特征在于,包括权利要求1所述引物对。
3.根据权利要求2所述试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括PCR扩增用试剂和/或反转录用试剂。
4.根据权利要求3所述试剂盒,其特征在于,所述PCR扩增用试剂包括普通PCR扩增用试剂或荧光PCR扩增用试剂;
所述荧光PCR扩增用试剂包括2×SYBRGreenqPCRMix;
所述普通PCR扩增用试剂包括10×PCR-buffer、dNTPs和r-Taq酶。
5.根据权利要求3所述试剂盒,其特征在于,所述反转录用试剂包括以下试剂中的一种或几种:解链液、5×RT-buffer、dNTPs、RNA酶抑制剂和反转录酶RTase。
6.权利要求1所述引物对或权利要求2~5任意一项所述试剂盒在检测柑橘植株感染RB-N1基因型柑橘衰退病毒中的应用。
7.一种基于RT-PCR技术检测RB-N1基因型柑橘衰退病毒的方法,其特征在于,包括以下步骤:
1)提取待检测样品的RNA;
2)将步骤1)中RNA进行反转录,得到cDNA;
3)以步骤2)中所述cDNA为模板,利用权利要求1所述引物对进行PCR扩增,得到PCR扩增产物;
4)将步骤3)中所述PCR扩增产物进行片段分析,得到待测样品是否感染RB-N1基因型柑橘衰退病毒的结果。
8.根据权利要求7所述方法,其特征在于,所述PCR扩增包括普通PCR扩增和荧光PCR扩增;
所述普通PCR扩增的反应程序为:95℃预变性3分钟;95℃变性20秒,55℃退火30秒,72℃延伸45秒,35个循环;
所述荧光PCR扩增的反应程序为:95℃预变性20s;95℃5s,55℃15s,72℃20s,40个循环。
9.根据权利要求8所述方法,其特征在于,根据PCR扩增的方法进行片段分析:当采用普通PCR扩增时,所得PCR扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳,若得到的条带为524bp,表示待测样品感染RB-N1基因型柑橘衰退病毒反之则没有感染或待检测样品感染RB-N1基因型柑橘衰退病毒的浓度没有达到检测限。
10.根据权利要求8所述方法,其特征在于,当采用荧光PCR扩增时,所得PCR扩增产物进行实时荧光定量检测,所得溶解曲线在退火温度为55℃时为单一峰,说明待测样品感染RB-N1基因型柑橘衰退病毒,反之则没有感染或待检测样品感染RB-N1基因型柑橘衰退病毒的浓度没有达到检测限。
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