[发明专利]基因组组合及其在制备鉴别肝脏癌变、组织分型及预后的制品中的用途

权利要求书

1.一种基因组组合，其特征在于，其包括：AHSA1、AKR1B10、B3GAT3、C7orf68、CCDC58、CCNB1、CENPW、CLEC3B、G6PD、GMNN、LPCAT1、NDUFA4L2、NT5DC2、PES1、PTP4A3、PTTG1、SFN、SPINK1、SPP1、STMN1、TACC3、TK1、UBE2T、GPC3、LCN2、MDK、PDZK1IP1、SPARCL1、THY1、UBD、UBE2C、PLVAP、DNASE1L3、SOCS2、CLEC4G、CYP1A2、FCN3基因组及其蛋白、RNA。

2.权利要求1所述的基因组组合在制备用于鉴别肝脏癌变、组织分型及预后的制品中的用途；

所述的组织分型为原发性肝癌和继发性肝癌,其中原发性肝癌包括：肝细胞癌(Hepatocellular carcinoma)、纤维板型癌(Fibrolamellar carcinoma)、胆管上皮癌(Hepatocholangio carcinoma)。

3.按权利要求2所述的用途，其特征在于，所述的基因组组合用于建立鉴别肝脏癌变、组织分型及预后的方法；

所述的方法中包括：癌变筛查、病理分型及预后与所述基因组组合及其蛋白、RNA在肝组织癌变前后出现表达量改变相关用于预测肝脏发生癌变、癌变细胞类型包括，肝细胞癌、纤维板型癌、肝胆管上皮癌、继发性肝癌及患者预后；其中，

S1联合所述基因组组合，2个及2个以上的任意组合，表达量改变预测肝脏是否癌变、肝癌类型及病人预后；

S2所述基因组组合与其它指标相结合后预测肝脏是否癌变、肝癌类型及病人预后。

4.按权利要求2或3所述的用途，其特征在于，制品或方法检测对象包括：肝病变组织包括癌变、增生、癌前病变、体液包括血液、尿液、穿刺液、穿刺组织，检测对象中的基因组组合表达量的改变作为预测肝脏癌变、组织分型、肝癌恶性程度、靶向药物筛选、转移能力、分子分型或生存期预后评估指标。

5.按权利要求2或3所述的用途，其特征在于，所述基因组组合产物，包括肿瘤细胞中的，和各种原因进入体液中的游离的mRNA、蛋白及外泌体中的mRNA、蛋白，包括完整和片段(mRNA、蛋白)。

6.按权利要求4所述的用途，其特征在于，所述的血液包括全血、血清、血浆、分离有核细胞、血液中的循环肿瘤细胞、血液中的外泌体。

7.按权利要求3所述的用途，其特征在于，所述的方法中，蛋白浓度检测包括直接提取肝病变组织蛋白经化学或免疫学方法进行检测和免疫组化分析。

8.按权利要求3所述的用途，其特征在于，所述的方法中，RNA浓度检测为直接提取肝病变组织RNA后结合RT-PCR技术、荧光定量PCR技术、RNA Sequencing、RNA array检测。

9.按权利要求3所述的用途，其特征在于，所述的方法中，所述的基因组组合的表达量包括：与自身内参的比较、与自身内参的比较后再与癌旁组织、与自身内参的比较后再与正常组织相比较。

10.按权利要求3所述的用途，其特征在于，所述的方法中，与其对应的正常组织相比，在肝癌组织中DNASE1L3、SOCS2、CLEC4G、CYP1A2、FCN3基因的表达量极度降低，而AHSA1、AKR1B10、B3GAT3、C7orf68、CCDC58、CCNB1、CENPW、G6PD、GMNN、LPCAT1、NDUFA4L2、NT5DC2、PES1、PTP4A3、PTTG1、SFN、SPINK1、SPP1、STMN1、TACC3、TK1、UBE2T、GPC3、LCN2、MDK、PDZK1IP1、SPARCL1、THY1、UBD、UBE2C、PLVAP基因表达量极度增高；CLEC3B在肝细胞癌和纤维板型癌中降低，在肝胆管上皮癌中增高。

11.按权利要求3所述的用途，其特征在于，所述的方法中，AHSA1、AKR1B10、B3GAT3、C7orf68、CCDC58、CCNB1、CENPW、G6PD、GMNN、LPCAT1、NDUFA4L2、NT5DC2、PES1、PTP4A3、PTTG1、SFN、SPINK1、SPP1、STMN1、TACC3、TK1、UBE2C、UBE2T基因的表达量增加提示肿瘤恶性程度高、患者预后差；而CLEC3B、DNASE1L3、PLVAP、SOCS2基因表达量较高者则肿瘤恶性程度低、患者预后好。