[发明专利]一种染色质外环状DNA的检测方法

权利要求书

1.一种染色质外环状DNA的检测方法，其特征在于，所述检测方法以eccDNA作为液态检测靶标，通过线性DNA的去除，ECCDNA的纯化、建库，测序与生物信息分析对反式剪切位点识别从而完成对eccDNA的鉴定与分析。

2.根据权利要求1所述的一种染色质外环状DNA的检测方法，其特征在于，所述检测方法包括以下步骤：

1)获取样本，富集样本中游离DNA；

2)利用酶切去除步骤1)的游离DNA中的线性DNA，保留eccDNA；

3)利用转座酶打断步骤2)的环状DNA，插入adaptor，进行扩增，建立文库；

4)对步骤3)的文库进行测序并鉴定相关eccDNA数目和染色质区域。

3.根据权利要求2所述的一种染色质外环状DNA的检测方法，其特征在于，步骤2)中，所述酶切为利用核酸外切酶进行酶切。

4.根据权利要求2所述的一种染色质外环状DNA的检测方法，其特征在于，步骤3)中，所述转座酶选自Tn1、Tn2、Tn3、Tn4、Tn5、Tn6、Tn7、Tn9以及Tn10中的一种或任意多种的组合。

5.根据权利要求4所述的一种染色质外环状DNA的检测方法，其特征在于，所述步骤3)中，扩增包括第一轮PCR扩增、qPCR扩增与第二轮PCR扩增。

6.根据权利要求5所述的一种染色质外环状DNA的检测方法，其特征在于，所述第二轮PCR扩增的循环数由qPCR扩增结果决定。

7.根据权利要求2-6任一项所述的一种染色质外环状DNA的检测方法，其特征在于，所述样本包括肿瘤患者外周血样本。

8.根据权利要求7所述的一种染色质外环状DNA的检测方法，其特征在于，步骤4)中测序基于二代测序平台。

9.权利要求1-8任一项所述的染色质外环状DNA的检测方法在监测肿瘤患者用药上的应用。

10.权利要求1-8任一项所述的染色质外环状DNA的检测方法在监测肿瘤患者预后eccDNA上的应用。