[发明专利]MTHFR基因SNP位点的应用及其检测引物和试剂盒在审
申请号: | 202111104850.2 | 申请日: | 2021-09-18 |
公开(公告)号: | CN114015760A | 公开(公告)日: | 2022-02-08 |
发明(设计)人: | 沈振亚;虞游;沈晗;邵联波;滕小梅 | 申请(专利权)人: | 苏州大学附属第一医院 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 北京集佳知识产权代理有限公司 11227 | 代理人: | 王欢 |
地址: | 215006 *** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | mthfr 基因 snp 应用 及其 检测 引物 试剂盒 | ||
本发明涉及生物技术领域,尤其涉及MTHFR基因SNP位点的应用及其检测引物和试剂盒。本发明研究发现MTHFR的基因多态性位点rs1801133的基因型与胸主动脉夹层致病风险具有显著关联,MTHFR基因SNP位点rs1801133的基因型为TT或CT的人群,较基因型为CC的人群胸主动脉夹层的致病风险高。实验表明,与正常人相比,患者rs1801133位点的基因型为TT或CT的比例显著提高(P0.01),因此,rs1801133位点可作为高血压敏感的胸主动脉夹层的分子诊断和预警标志物。结合血清中同型半胱氨酸的含量(基线15μmol/L)可对胸主动脉夹层进行更为准确的评估和诊断。
技术领域
本发明涉及生物技术领域,尤其涉及MTHFR基因SNP位点的应用及其检测引物和试剂盒。
背景技术
胸主动脉夹层血管外科的常见疾病,指主动脉内血液通过破裂的内膜进入到血管中膜,逐渐沿着血管长轴方向进展,形成血管内外真假两个腔隙,俗称主动脉夹层。临床主要表现为急性发作的剧烈性胸部疼痛,呈刀割样或者撕裂样的感觉难以忍。该病是致死率极高的心血管重症,其发病急、治疗棘手、预后差,极大地增加了我国公共卫生的负担。
高血压作为胸主动脉夹层的独立风险因素,极大地增加了患病风险。中老年人为好发人群,高峰年龄是50~70岁,男女比例约2~3:1。65%~70%在急性期死于心脏压塞、心律失常等,因此,降低胸主动脉夹层死亡率的关键在于早期干预和风险预警。然而,目前临床上尚未有明确的适用于胸主动脉夹层的分子标志物。
发明内容
有鉴于此,本发明提供了MTHFR基因SNP位点的应用及其检测引物和试剂盒。本发明提供的检测引物和试剂盒适用于MTHFR基因SNP位点rs1801133的检测,灵敏性高、特异性强。
为了实现上述发明目的,本发明提供以下技术方案:
本发明提供了MTHFR基因SNP位点rs1801133的试剂在制备评估胸主动脉夹层致病风险的试剂盒中的应用。
其中,所述胸主动脉夹层为高血压敏感的胸主动脉夹层。
本发明通过全基因组重测序和全外显子测序发现,胸主动脉夹层患者中亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)存在典型的基因多态性(ENST00000376583:p.Ala263Val/c.788CT),并且与患者血清中的同型半胱氨酸含量具有高度一致性。具体表现为:患者rs1801133位点的基因型(TT或CT),其血清中同型半胱氨酸的含量严重超标;而rs1801133位点的基因型(CC),其同型半胱氨酸含量基本保持正常。研究表明,MTHFR的基因多态性位点rs1801133的基因型与胸主动脉夹层致病风险具有显著关联。MTHFR基因SNP位点rs1801133的基因型为TT或CT的人群,较基因型为CC的人群胸主动脉夹层的致病风险高。
本发明还提供了检测MTHFR基因SNP位点rs1801133的引物对,包括核苷酸序列如SEQ IDNO:1所示的上游引物和核苷酸序列如SEQ IDNO:2所示的下游引物。
本发明还提供一种评估胸主动脉夹层致病风险的试剂盒,包括SEQ IDNO:1~2所示的引物对。
本发明提供的试剂盒还包括PCR扩增试剂。
进一步的,所述PCR扩增试剂包括PCRMasterMix和PCR-gradewater。
本发明提供的试剂盒还包括酶切试剂。
进一步的,所述酶切试剂包括T7EndonucleaseI核酸酶、NEBBuffer2和PCR-gradewater。
本发明还提供一种检测MTHFR基因SNP位点rs1801133基因型的方法,包括以下步骤:
步骤1:以待测样本的DNA为模板,以权利要求4所述的引物对进行PCR扩增,获得PCR扩增产物;
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