[发明专利]检测HLA-A基因SNP标记rs1136697-G的PCR扩增引物、试剂盒及方法在审
申请号: | 202111112575.9 | 申请日: | 2021-09-23 |
公开(公告)号: | CN113755593A | 公开(公告)日: | 2021-12-07 |
发明(设计)人: | 田伟;李立新;程文 | 申请(专利权)人: | 中南大学 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 长沙朕扬知识产权代理事务所(普通合伙) 43213 | 代理人: | 郭蓓霏 |
地址: | 410083 *** | 国省代码: | 湖南;43 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 hla 基因 snp 标记 rs1136697 pcr 扩增 引物 试剂盒 方法 | ||
1.一种检测HLA-A基因SNP标记rs1136697-G的PCR扩增引物,其特征在于,包括上游引物rs113-SF2和下游rs113-REV1,其碱基序列如下:
rs113-SF2:5’-CACACCgTCCAgAggATgAg-3’;
rs113-REV1:5’-TgCgCTgCAgCgTCTCCTT-3’。
2.一种试剂盒,其特征在于,包含如权利要求1所述的PCR扩增引物。
3.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,包含:1.3pmole上游引物rs113-SF2、1.3pmole下游引物rs113-REV1、5μL 2×Taq MastMix和ddH2O。
4.一种检测HLA-A基因SNP标记rs1136697-G的方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)提取样本DNA;
(2)利用权利要求1所述的PCR扩增引物,对所述步骤(1)得到的样本DNA进行PCR扩增;
(3)将所述步骤(2)得到的PCR扩增产物进行琼脂糖电泳,读取电泳结果;若同时出现268bp和360bp的条带,则鉴定为rs1136697-G阳性样本;若仅出现360bp的条带,则鉴定为rs1136697-G阴性样本。
5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,所述PCR扩增的反应体系含:2×TaqMastMix5μL、上游引物rs113-SF2 1.3pmole、下游引物rs113-REV1 1.3pmole、基因组DNA50ng,用灭菌ddH2O补足反应体系至10μL。
6.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,所述PCR扩增的反应参数条件为:预变性95℃,2min;95℃变性30s,63℃退火50s,72℃延伸30s,循环35次,再72℃延伸5min。
7.根据权利要求4-6中任一项所述的方法,其特征在于,所述琼脂糖电泳的参数条件为:采用2%琼脂糖电泳,200V,电泳15min。
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