[发明专利]一种用于鉴定中国荷斯坦牛乳房炎抗性的引物组合、方法及应用

说明书

本发明公开了一种用于鉴定中国荷斯坦牛乳房炎抗性的引物组合、方法及应用。该方法包括如下步骤：检测待测中国荷斯坦牛基于SNP1位点(rs135854456)、SNP11位点(位于中国荷斯坦牛基因组第5号染色体的第104010752位)、SNP15位点(rs109421300)和SNP16位点(rs109350371)的基因型，如果基于SNP1位点的基因型为CC纯合型、基于SNP11位点的基因型为CC纯合型、基于SNP15位点的基因型为AA纯合型且基于SNP16位点的基因型为AA纯合型，待测中国荷斯坦牛具有乳房炎抗性。本发明提供的方法可以准确鉴定中国荷斯坦牛乳房炎抗性，具有重要的应用价值。

技术领域

本发明属于生物技术领域，具体涉及一种用于鉴定中国荷斯坦牛乳房炎抗性的引物组合、方法及应用。

背景技术

奶牛乳房炎即奶牛乳房发生的炎症，其为奶牛乳腺最常见的疾病且属于复杂疾病。奶牛乳房炎是乳腺组织发生的不同程度的病理学变化，其导致乳汁体细胞数(Somaticcell count，SCC)增多，牛奶产量和品质大幅度降低，对世界乳业发展影响巨大。一方面在实际饲养时，牛场通常通过检测SCC对牛群乳房健康状况进行管理，即SCC作为判断奶牛乳房炎的间接指标(如健康牛的SCC为10万/mL以下)，以控制牛奶质量，但利用SCC判断奶牛乳房炎的标准并未统一，其判断结果受环境影响也并不稳定准确。另一方面，传统奶牛育种工作中，通常以低的体细胞评分(Somatic cell score，SCS)为育种目标间接提升奶牛乳房炎抗性，但此选择方法取得的遗传进展有限。因此，在规范用药、大规模施行替抗、减抗养殖战略的趋势下，建立针对中国荷斯坦牛乳房炎抗性鉴定标准，对于提升奶牛生产性能，提高乳房炎抗性牛育种效率显得尤为重要。

近年来，SNP作为第三代分子标记，以其数量多、分布广、遗传稳定等优点受到广泛重视。基于中国荷斯坦牛的基因信息进行分析，可以挖掘更加稳定高效的SNP位点。因此，有必要探索基于基因多态性有效进行中国荷斯坦牛乳房炎抗性鉴定的方法。采用等位基因竞争性特异PCR法，可以开发其特异性引物，获得样本在SNP位点的基因型，最终针对中国荷斯坦牛乳房炎抗性进行鉴定。

发明内容

本发明的目的为鉴定中国荷斯坦牛乳房炎抗性。

本发明首先保护引物组合。所述引物组合可包括引物组1—引物组4；

所述引物组1由SEQ ID NO:1所示的正向引物01F1、SEQ ID NO:2所示的正向引物01F2和SEQ ID NO:3所示的反向引物01R组成；

所述引物组2由SEQ ID NO:4所示的正向引物02F1、SEQ ID NO:5所示的正向引物02F2和SEQ ID NO:6所示的反向引物02R组成；

所述引物组3由SEQ ID NO:7所示的正向引物03F1、SEQ ID NO:8所示的正向引物03F2和SEQ ID NO:9所示的反向引物03R组成；

所述引物组4由SEQ ID NO:10所示的正向引物04F1、SEQ ID NO:11所示的正向引物04F2和SEQ ID NO:12所示的反向引物04R组成。

上述引物组合中，所述正向引物01F1、所述正向引物02F1、所述正向引物03F1和所述正向引物04F1可进行FAM荧光标记。所述正向引物01F2、所述正向引物02F2、所述正向引物03F2和所述正向引物04F2可进行HEX荧光标记。

所述引物组合具体可由所述引物组1、所述引物组2、所述引物组3和所述引物组4组成。

上述任一所述引物组合在制备用于鉴定或辅助鉴定中国荷斯坦牛是否具有乳房炎抗性的试剂盒中的应用也属于本发明的保护范围。

上述任一所述引物组合在制备用于辅助筛查具有乳房炎抗性的中国荷斯坦牛的试剂盒中的应用也属于本发明的保护范围。