[发明专利]鉴定钩吻及易混淆品和待测样本是否掺入钩吻的方法在审
申请号: | 202111136837.5 | 申请日: | 2021-09-27 |
公开(公告)号: | CN113684265A | 公开(公告)日: | 2021-11-23 |
发明(设计)人: | 韩建萍;王刚;白璇姣 | 申请(专利权)人: | 中国医学科学院药用植物研究所 |
主分类号: | C12Q1/686 | 分类号: | C12Q1/686;C12N15/11 |
代理公司: | 北京红花知识产权代理事务所(普通合伙) 16030 | 代理人: | 林乐飞 |
地址: | 100193 北京市海*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 鉴定 混淆 样本 是否 掺入 方法 | ||
1.一种用于快速鉴别钩吻及其易混淆品的方法,其包括以下步骤:
1)提取钩吻及其易混淆品的植物或药材的样本中的DNA,获取所述样本中的全基因组DNA;
2)以所述全基因组DNA为模板,通过HRM-PCR扩增,获得包含完整内部转录间隔区2序列区域的扩增产物;
3)对扩增过程中的HRM曲线进行分析,从而实现所述钩吻及其易混淆品的鉴别。
2.根据权利要求1所述的方法,其中所述钩吻为马钱科钩吻原植物及其药材。
3.根据权利要求1所述的方法,其中所述易混淆品为忍冬、粗叶榕、狼毒及白屈菜的原植物及其药材。
4.根据权利要求1至3中任一项所述的方法,其中所述HRM-PCR扩增使用SEQ ID No.1:5'-ATGCGATACTTGGTGTGAAT-3'的正向引物和SEQ ID No.2:5'-GACGCTTCTCCAGACTACAAT-3'的反向引物。
5.根据权利要求1至3中任一项所述的方法,其中所述HRM-PCR扩增的体系包含12.5ul2×HRM PCR Master Mix,所述正向引物和所述反向引物各1ul和2.5uM,所述全基因组DNA模板2ul,并且向所述体系中加灭菌双蒸水至25ul。
6.根据权利要求1至3中任一项所述的方法,其中所述HRM-PCR扩增的程序为:94℃,5min;94℃30s,56℃30s,72℃45s,40个循环;HRM,2s,75℃-95℃。
7.一种用于鉴定待测样本中是否掺入钩吻的方法,其包括以下步骤:
1)从待测样本中分离提取总DNA并且获取所述待测样本中的全基因组DNA,同时提取已知的钩吻样本的总DNA作为阳性对照组;
2)以所述全基因组DNA为模板,通过HRM-PCR扩增,获得包含完整内部转录间隔区2序列区域的扩增产物;
3)对扩增过程中的HRM曲线进行分析,将所述待测样本的HRM曲线与所述阳性对照组相比较,从而鉴定所述待测样本中是否掺入钩吻。
8.根据权利要求7所述的方法,其中所述钩吻为马钱科钩吻原植物及其药材,所述待测样本包含忍冬、粗叶榕、狼毒及白屈菜的原植物及其药材;优选地,所述钩吻的DNA浓度与所述待测样本的总DNA浓度之比为0%、10%、25%、50%、75%、90%、100%。
9.根据权利要求7所述的方法,其中所述HRM-PCR扩增使用SEQ ID No.1:5'-ATGCGATACTTGGTGTGAAT-3'的正向引物和SEQ ID No.2:5'-GACGCTTCTCCAGACTACAAT-3'的反向引物。
10.根据权利要求7至9中任一项所述的方法,其中所述HRM-PCR扩增的体系包含12.5ul2×HRM PCR Master Mix,所述正向引物和所述反向引物各1ul和2.5uM,所述全基因组DNA模板2ul,向所述体系中加灭菌双蒸水至25ul;并且所述HRM-PCR扩增的程序为:94℃,5min;94℃30s,56℃30s,72℃45s,40个循环;HRM,2s,75℃-95℃。
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