[发明专利]一种微孔阵列芯片的数字PCR实时分析方法在审

专利信息
申请号: 202111145791.3 申请日: 2021-09-28
公开(公告)号: CN113846149A 公开(公告)日: 2021-12-28
发明(设计)人: 夏江;高鹏 申请(专利权)人: 领航基因科技(杭州)有限公司
主分类号: C12Q1/686 分类号: C12Q1/686;B01L7/00;G16B20/30;G06K9/62
代理公司: 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 代理人: 陆惠中
地址: 311227 浙江省杭*** 国省代码: 浙江;33
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摘要:
搜索关键词: 一种 微孔 阵列 芯片 数字 pcr 实时 分析 方法
【权利要求书】:

1.一种微孔阵列芯片的数字PCR实时分析方法,其特征在于,包括以下步骤:

S1:微孔的倾斜矫正;

S2:图片的偏移矫正;

S3:提取荧光值;

S4:基于随机森林计算预测CT值。

2.根据权利要求1所述的数字PCR实时分析方法,其特征在于,S1包括:

S11假设第i个循环中微孔图片表示为Micro_imgi,Micro_imgi包括的微孔的数量为NUM_micro,微孔的中心坐标位置表示point(posxk,posyk),其中0k≤NUM_micro;0i≤NUM_loop,NUM_loop表示循环次数;

S12新建一张与微孔图片Micro_imgi尺寸相同的图片,记为Gray_cpimgi,Gray_cpimgi像素值为0;

S13遍历Micro_imgi中的微孔单元,如果微孔point(posxm,posym)与微孔point(posxn,posyn)满足:abs(posxm-(posxn)≤20abs(posym-posyn)≤7,则以point(posxm,posym)为起始点,point(posxn,posyn)为终点,在图片Gray_cpimgi对应位置连接两坐标点,直线的像素值大小为255;

S14以point(posxm,posym-1)为起始点,point(posxn,posyn-1)为终点,在图片Gray_cpimgi对应位置连接两坐标点,直线的像素值大小为200;

S15以point(posxm,posym+1)为起始点,point(posxn,posyn+1)为终点,在图片Gray_cpimgi对应位置连接两坐标点,直线的像素值大小为200;

S16以point(posxm,posym-2)为起始点,point(posxn,posyn-2)为终点,在图片Gray_cpimgi对应位置连接两坐标点,直线的像素值大小为200;

S17以point(posxm,posym+2)为起始点,point(posxn,posyn+2)为终点,在图片Gray_cpimgi对应位置连接两坐标点,直线的像素值大小为200;

S18以point(posxm,posym-3)为起始点,point(posxn,posyn-3)为终点,在图片Gray_cpimgi对应位置连接两坐标点,直线的像素值大小为150;

S19以point(posxm,posym+3)为起始点,point(posxn,posyn+3)为终点,在图片Gray_cpimgi对应位置连接两坐标点,直线的像素值大小为150;

S110以point(posxm,posym-4)为起始点,point(posxn,posyn-4)为终点,在图片Gray_cpimgi对应位置连接两坐标点,直线的像素值大小为150;

S111以point(posxm,posym+4)为起始点,point(posxn,posyn+4)为终点,在图片Gray_cpimgi对应位置连接两坐标点,直线的像素值大小为150;

S112以point(posxm,posym-5)为起始点,point(posxn,posyn-5)为终点,在图片Gray_cpimgi对应位置连接两坐标点,直线的像素值大小为100;

S113以point(posxm,posym+5)为起始点,point(posxn,posyn+5)为终点,在图片Gray_cpimgi对应位置连接两坐标点,直线的像素值大小为100;

S114以point(posxm,posym-6)为起始点,point(posxn,posyn-6)为终点,在图片Gray_cpimgi对应位置连接两坐标点,直线的像素值大小为100;

S115以point(posxm,posym+6)为起始点,point(posxn,posyn+6)为终点,在图片Gray_cpimgi对应位置连接两坐标点,直线的像素值大小为100;

S116设置图片Gray_cpimgi起始旋转角度为first_anglei=-5和终止选择角度为end_anglei=5,选择步长设置为step_anglei=0.02;Gray_cpimgi的中心坐标为point_center(poscenx,posceny),其中

For rorate_angle first_anglei:end_anglei步长为step_anglei

Gray_cpimgi以point_center(poscenx,posceny)为中心点,旋转角度rorate_angle;

每次旋转后,计算图像每一行的像素值之和,且把像素值之和赋予img_graycolssumi(u,v),其中0≤uimg_height,0≤vrorate_sizei,

S117计算img_graycolssumi(u,v)每一行的最大值,且对最大值对应的旋转角度进行统计。如果旋转角度出现的次数最多,那么设置为图片Micro_imgi矫正角度。

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