[发明专利]一种微孔阵列芯片的数字PCR实时分析方法在审
申请号: | 202111145791.3 | 申请日: | 2021-09-28 |
公开(公告)号: | CN113846149A | 公开(公告)日: | 2021-12-28 |
发明(设计)人: | 夏江;高鹏 | 申请(专利权)人: | 领航基因科技(杭州)有限公司 |
主分类号: | C12Q1/686 | 分类号: | C12Q1/686;B01L7/00;G16B20/30;G06K9/62 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 陆惠中 |
地址: | 311227 浙江省杭*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 微孔 阵列 芯片 数字 pcr 实时 分析 方法 | ||
1.一种微孔阵列芯片的数字PCR实时分析方法,其特征在于,包括以下步骤:
S1:微孔的倾斜矫正;
S2:图片的偏移矫正;
S3:提取荧光值;
S4:基于随机森林计算预测CT值。
2.根据权利要求1所述的数字PCR实时分析方法,其特征在于,S1包括:
S11假设第i个循环中微孔图片表示为Micro_imgi,Micro_imgi包括的微孔的数量为NUM_micro,微孔的中心坐标位置表示point(posxk,posyk),其中0k≤NUM_micro;0i≤NUM_loop,NUM_loop表示循环次数;
S12新建一张与微孔图片Micro_imgi尺寸相同的图片,记为Gray_cpimgi,Gray_cpimgi像素值为0;
S13遍历Micro_imgi中的微孔单元,如果微孔point(posxm,posym)与微孔point(posxn,posyn)满足:abs(posxm-(posxn)≤20abs(posym-posyn)≤7,则以point(posxm,posym)为起始点,point(posxn,posyn)为终点,在图片Gray_cpimgi对应位置连接两坐标点,直线的像素值大小为255;
S14以point(posxm,posym-1)为起始点,point(posxn,posyn-1)为终点,在图片Gray_cpimgi对应位置连接两坐标点,直线的像素值大小为200;
S15以point(posxm,posym+1)为起始点,point(posxn,posyn+1)为终点,在图片Gray_cpimgi对应位置连接两坐标点,直线的像素值大小为200;
S16以point(posxm,posym-2)为起始点,point(posxn,posyn-2)为终点,在图片Gray_cpimgi对应位置连接两坐标点,直线的像素值大小为200;
S17以point(posxm,posym+2)为起始点,point(posxn,posyn+2)为终点,在图片Gray_cpimgi对应位置连接两坐标点,直线的像素值大小为200;
S18以point(posxm,posym-3)为起始点,point(posxn,posyn-3)为终点,在图片Gray_cpimgi对应位置连接两坐标点,直线的像素值大小为150;
S19以point(posxm,posym+3)为起始点,point(posxn,posyn+3)为终点,在图片Gray_cpimgi对应位置连接两坐标点,直线的像素值大小为150;
S110以point(posxm,posym-4)为起始点,point(posxn,posyn-4)为终点,在图片Gray_cpimgi对应位置连接两坐标点,直线的像素值大小为150;
S111以point(posxm,posym+4)为起始点,point(posxn,posyn+4)为终点,在图片Gray_cpimgi对应位置连接两坐标点,直线的像素值大小为150;
S112以point(posxm,posym-5)为起始点,point(posxn,posyn-5)为终点,在图片Gray_cpimgi对应位置连接两坐标点,直线的像素值大小为100;
S113以point(posxm,posym+5)为起始点,point(posxn,posyn+5)为终点,在图片Gray_cpimgi对应位置连接两坐标点,直线的像素值大小为100;
S114以point(posxm,posym-6)为起始点,point(posxn,posyn-6)为终点,在图片Gray_cpimgi对应位置连接两坐标点,直线的像素值大小为100;
S115以point(posxm,posym+6)为起始点,point(posxn,posyn+6)为终点,在图片Gray_cpimgi对应位置连接两坐标点,直线的像素值大小为100;
S116设置图片Gray_cpimgi起始旋转角度为first_anglei=-5和终止选择角度为end_anglei=5,选择步长设置为step_anglei=0.02;Gray_cpimgi的中心坐标为point_center(poscenx,posceny),其中
For rorate_angle first_anglei:end_anglei步长为step_anglei
Gray_cpimgi以point_center(poscenx,posceny)为中心点,旋转角度rorate_angle;
每次旋转后,计算图像每一行的像素值之和,且把像素值之和赋予img_graycolssumi(u,v),其中0≤uimg_height,0≤vrorate_sizei,
S117计算img_graycolssumi(u,v)每一行的最大值,且对最大值对应的旋转角度进行统计。如果旋转角度出现的次数最多,那么设置为图片Micro_imgi矫正角度。
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