[发明专利]一种基于PQ500的蛋白DIA绝对定量方法在审
申请号: | 202111163682.4 | 申请日: | 2021-09-30 |
公开(公告)号: | CN113933417A | 公开(公告)日: | 2022-01-14 |
发明(设计)人: | 阮宏强;薛冰冰;张惠萍 | 申请(专利权)人: | 上海中科新生命生物科技有限公司 |
主分类号: | G01N30/02 | 分类号: | G01N30/02 |
代理公司: | 北京科亿知识产权代理事务所(普通合伙) 11350 | 代理人: | 肖平安 |
地址: | 201109 上海*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 pq500 蛋白 dia 绝对 定量 方法 | ||
1.一种基于PQ500的蛋白DIA绝对定量方法,其特征在于,血浆样本依次经过变性还原、烷基化、除盐和酶解步骤制备成多肽,再向多肽中添加PQ500重标肽段,最后使用高效液相色谱和质谱平台对多肽进行DIA采集模式分析,实现血浆中蛋白的DIA绝对定量。
2.根据权利要求1所述的一种基于PQ500的蛋白DIA绝对定量方法,其特征在于,其包括以下详细步骤:
步骤S1,取血清蛋白样品加入8M尿素和1M二硫苏糖醇,37℃反应1h进行变性还原;
步骤S2,血清蛋白样品变性还原后自然冷却至室温,再加入1M碘乙酰胺,室温避光反应30min进行烷基化;
步骤S3,烷基化后再向样品加入50mM碳酸氢铵将尿素浓度稀释至2M,再加入赖氨酰内肽酶在30℃酶切反应2h;
步骤S4,再向样品加入50mM碳酸氢铵将尿素浓度稀释至1M或以下,加入胰蛋白酶在37℃过夜酶解;最后,调节溶液pH至酸性终止酶解;
步骤S5,加入甲醇活化脱盐柱后再加入超纯水平衡脱盐柱,步骤S4中最后获得的肽段加入三氟乙酸酸化至pH值为2-3后加入到已经平衡的脱盐柱中,静置;
步骤S6,向脱盐柱中加入2%甲酸洗去样本中的盐,再加入5%甲醇对脱盐柱进行清洗;
步骤S7,再加入40%NH4OH乙腈溶液洗脱肽段,将洗脱液冷冻干燥成粉末;
步骤S8,使用0.1%甲酸复融步骤S7获得的肽段粉末,加入PQ500重标肽段,上样进行液相色谱和质谱分析,质谱分析采用DIA采集模式分析。
3.根据权利要求2所述的一种基于PQ500的蛋白DIA绝对定量方法,其特征在于,所述的步骤S1中,尿素的添加量是与血清蛋白样品按体积比1:1的添加;二硫苏糖醇添加后的终浓度是20mM;所述的步骤S2中,碘乙酰胺添加后的终浓度是50mM;所述的步骤S3中,赖氨酰内肽酶的添加质量比例是样品:赖氨酰内肽酶=50:1;所述的步骤S4中,胰蛋白酶的添加质量比例是样品:胰蛋白酶=50:1。
4.根据权利要求3所述的一种基于PQ500的蛋白DIA绝对定量方法,其特征在于,所述的步骤S5中,重复两次加入超纯水平衡脱盐柱;所述的步骤S6中,重复两次加入2%甲酸进行脱盐;所述的步骤S7中,重复两次加入40%NH4OH乙腈溶液洗脱肽段,并合并洗脱液。
5.根据权利要求3所述的一种基于PQ500的蛋白DIA绝对定量方法,其特征在于,所述的步骤S8还包括步骤S81,复融肽段粉末后测定肽段浓度。
6.根据权利要求3所述的一种基于PQ500的蛋白DIA绝对定量方法,其特征在于,所述的液相色谱的条件如下:色谱柱为C18(75μm*200mm),流动相A为0.1%FA水溶液,流动相B为0.1%FA乙腈溶液。
7.根据权利要求6所述的一种基于PQ500的蛋白DIA绝对定量方法,其特征在于,所述的质谱条件如下:120min DIA检测,数据在正离子模式下进行采集,Full MS中分辨率为60K,AGC为3e6,最大进样时间为50ms,扫描范围:350-1650m/z;DIA中分辨率为15K,AGC为3e6,最大进样时间为auto,归一化碰撞能量(NCE)为27%。
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