[发明专利]与草鱼果糖-1,6-二磷酸酶相关的5个SNPs标记及应用

权利要求书

1.与草鱼生长性状相关的SNPs标记，所述SNPs标记如SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2、SEQID NO.3、SEQ ID NO.4和SEQ ID NO.5至少一种所示；其中所述SEQ ID NO.1自5’端起第194位碱基为C或T；所述SEQ ID NO.2自5’端起第172位碱基为C或T；所述SEQ ID NO.3自5’端起第229位碱基为T或A；所述SEQ ID NO.4自5’端起第147位碱基为G或A；所述SEQ ID NO.5自5’端起第10位碱基为C或A。

2.根据权利要求1所述的SNPs标记，其特征在于，序列为SEQ ID NO.1的SNP标记的CC基因型个体的生长性状优势显著高于TT基因型个体；

优选的，序列为SEQ ID NO.3的SNP标记的AA基因型个体的生长性状优势显著高于TT基因型个体；

优选的，序列为SEQ ID NO.5的SNP标记的AC基因型个体的生长性状优势显著高于CC基因型个体；

优选的，序列为SEQ ID NO.1的SNP标记的CT基因型、序列为SEQ ID NO.3的SNP标记的AA基因型、序列为SEQ ID NO.5的SNP标记的AA基因型的个体的生长性状优势显著高于其余基因型个体。

3.根据权利要求1或2所述的SNPs标记，其特征在于，所述生长性状为体重、体长、提高、体宽或肥满度。

4.一种引物，其特征在于，所述引物用于扩增权利要求1～3任一项所述的SNPs标记；优选地，用于扩增SEQ ID NO.1所示SNP标记的引物如SEQ ID NO.6和SEQ ID NO.7所示；用于扩增SEQ ID NO.2所示SNP标记的引物如SEQ ID NO.9和SEQ ID NO.10所示；用于扩增SEQID NO.3所示SNP标记的引物如SEQ ID NO.12和SEQ ID NO.13所示；用于扩增SEQ ID NO.4所示SNP标记的引物如SEQ ID NO.15和SEQ ID NO.16所示；用于扩增SEQ ID NO.5所示SNP标记的引物如SEQ ID NO.15和SEQ ID NO.16所示。

5.一种试剂盒，包括权利要求4所述的引物。

6.权利要求1～3任一项所述的分子标记或权利要求4所述的引物或权利要求5所述的试剂盒在检测草鱼样本生长性状中的应用。

7.权利要求1～3任一项所述的分子标记或权利要求4所述的引物或权利要求5所述的试剂盒在筛选快长和/或体型修长的草鱼样本中的应用。

8.权利要求1～3任一项所述的分子标记或权利要求4所述的引物或权利要求5所述的试剂盒在草鱼种质资源改进中的应用。

9.一种用于筛选快长和/或体型修长草鱼样本的方法，通过对草鱼样本进行SEQ IDNO.1、SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.5至少一种SNPs标记的检测，选择如下(I)～(IV)任意一种个体：

(I)SEQ ID NO.1标记为CC基因型；

(II)SEQ ID NO.3标记为AA基因型；

(III)SEQ ID NO.5标记为AC基因型；

(IV)SEQ ID NO.1标记为CT基因型、SEQ ID NO.3标记为AA基因型、SEQ ID NO.5标记为AA基因型。

10.根据权利要求9所述的方法，其特征在于，包含以下步骤：

S1：提取待检测样品DNA；

S2：以DNA为模板，利用权利要求4所述引物进行PCR扩增，得到PCR产物；

S3：对PCR扩增产物进行测序，根据测序结果确定样品的SNPs标记的基因型来筛选生长性状优势的个体。