[发明专利]与草鱼果糖-1,6-二磷酸酶相关的5个SNPs标记及应用

说明书

本发明公开了与草鱼果糖‑1,6‑二磷酸酶相关的5个SNPs标记及应用。所述SNPs标记分别如SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.3、SEQ ID NO.4和SEQ ID NO.5至少一种所示。本发明发现SEQ ID NO.1标记为CC基因型和/或SEQ ID NO.3标记为AA基因型和/或SEQ ID NO.5标记为AC基因型和/或SEQ ID NO.1标记为CT基因型、SEQ ID NO.3标记为AA基因型、SEQ ID NO.5标记为AA基因型的个体生长性状具有显著优势，利用该SNPs标记简单快速的鉴定快长且体型修长的草鱼，为草鱼分子标记辅助选择育种提供基础。

技术领域

本发明属于分子生物技术领域，具体涉及与草鱼果糖-1,6-二磷酸酶相关的5个SNPs标记及应用。

背景技术

草鱼(Ctenopharyngodonidellus)属鲤科(Leuciscinae)、雅罗鱼亚科(Ctenopharyngodon)，在我国有着多年的养殖历史，其肉质鲜美、刺少且养殖产量高，一直深受消费者和养殖户的喜爱。2018年我国草鱼养殖产量达550万吨，占淡水养殖鱼类产量的21％，在我国，拥有草鱼养殖的地区十分广泛，共有30个省(市、自治区)有养殖，而在2018年广东省的草鱼产量最高。天然水体中草鱼身形细长，脂肪含量低，生长缓慢，人工养殖的草鱼主要投喂配合饲料，虽生长速度快，但多数腹部脂肪堆积，不受消费者喜欢。至今，虽然水产工作者已经付出了很多的努力，但草鱼仍未有通过国家良种审定委员会鉴定的人工选育的良种，实际生产上多为野生种直接驯化而成，缺少定向选育，生产上经常出现因亲本质量差，造成后代生长速度慢、规格不齐、抗病力差等问题，养殖户常常面临重大的经济损失，因此，选育高产优质的草鱼良种一直是草鱼育种工作的中心目标。

碳水化合物在生物体内，在有氧条件下经过糖酵解过程产生能量和一些合成氨基酸、核糖及脂类的中间产物。而与糖酵解相反的过程称为糖异生，在糖异生的反应过程中，果糖-1,6-二磷酸酶(fructose-1,6-bisphosphatase)是途径中的限速酶之一，它催化果糖-1,6-二磷酸水解成果糖-6-磷酸和无机磷，而果糖-6-磷酸又是各种生物合成途径中的重要前体。在动物体内，肝脏和肾脏是主要发生这一生理反应的器官，在其他内脏器官中几乎不发生。

选育出生长速度更快的草鱼新品种可以节约饲料成本，缩短养殖周期进而大幅度降低草鱼养殖成本，因此，开发快速可靠的育种技术，进行草鱼快长品种(系)的培育十分必要。在开展常规选育研究的同时，开发和应用分子标记辅助育种技术可加快草鱼良种选育进程。SNP是指基因组DNA序列中由于单个核苷酸变异而产生的多态性，位于基因编码区的非同义SNP可导致氨基酸的变化，从而影响蛋白质的功能，特别是发生在结构功能区域的SNP尤其重要，最终引起生物表型的变化。

发明内容

本发明的目的在于提供一种与草鱼生长性状相关的SNPs分子标记及其应用。

本发明所采取的技术方案是：

本发明的第一方面，提供与草鱼生长性状相关的SNPs标记，所述SNPs标记如SEQID NO.1、SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.3、SEQ ID NO.4和SEQ ID NO.5至少一种所示；其中所述SEQ ID NO.1自5’端起第194位碱基为C或T；所述SEQ ID NO.2自5’端起第172位碱基为C或T；所述SEQ ID NO.3自5’端起第229位碱基为T或A；所述SEQ ID NO.4自5’端起第147位碱基为G或A；所述SEQ ID NO.5自5’端起第10位碱基为C或A。

在本发明的一些实施方式中，所述SNP标记如SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2、SEQ IDNO.3、SEQ ID NO.4和SEQ ID NO.5所示。

在本发明的一些实施方式中，序列为SEQ ID NO.1的SNP标记的CC基因型个体的生长性状优势显著高于TT基因型个体。